海外醫療 基因變異到底意味著什么？

臨床實驗室通過血液樣本來檢測基因及其變異，這種方法以驚人的速度發展，但不同實驗室對一些基因變異的解釋卻出現了矛盾。研究人員近日在《Journal of Clinical Oncology》雜志上公布了調查結果，他們發現不同實驗室對多達24%的變異有不同的解釋。

不同實驗室對變異的解釋出現矛盾

作為該研究的引領者之一，賓夕法尼亞大學醫學院的研究人員對一個在線注冊列表中的基因檢測數據進行調查。該注冊列表名為PROMPT（Prospective Registry Of Multi-PlexTesting，多功能試驗前瞻性登記），于2014年成立，由賓夕法尼亞大學醫學院、Dana-Farber癌癥研究所、以及紀念斯隆凱特林癌癥中心共同創辦，旨在解決癌癥易感性檢測中遇到的具有挑戰性的問題。

研究人員選取了PROMPT注冊列表中的518組數據，其中大約95%的數據來自女性，68%被診斷為癌癥。總體來說，這些受試對象均檢測了數百種不同的基因，變異可能改變它們編碼蛋白質的功能，從而增加患者的疾病風險。研究人員比較了不同實驗室對603個變異的解釋，不過他們將兩個著名的癌癥風險基因BRCA1和BRCA2排除在外。結果發現，在603個基因變異中，74%的變異在不同的實驗室報告中有相似的解釋，但大約24%的變異在不同的實驗室報告中有不同的解釋。大多數解釋不一致的基因變異被一些實驗室定義為良性變異，而另外一些實驗室認為是意義不明變體。

更糟糕的是，對于解釋出現矛盾的變異，其中有36%影響了九分之一的被測試者，其中一個變異至少在一個實驗室報告中被認為是可能或肯定促進癌癥的發展，但在其他實驗室的報告中卻被視為意義不明變體。“這種差異將對患者的管理產生實際影響”賓夕法尼亞大學醫學院腫瘤學教授Susan M.Domchek醫學博士說。

解釋出現矛盾的變異常見于CHEK2、PALB2和BRIP1腫瘤抑制基因上。

呼吁數據共享——

意義不明通常意味著該變異對基因編碼蛋白功能的影響不確定，從而對癌癥風險的影響也是未知的。從自身角度來講，對患者的管理不應因這種變體的存在而發生變化，但在某些情況下，患者因此產生的焦慮足以讓其動了接受手術的念頭，而這些手術很有可能是不必要的，例如切除完全健康的乳房。“重要的是要明白，應該用不同的方法來對待意義不明變體與已知有害的變體”Domchek說。

當對基因變異的風險未達到共識就將其納入基因檢測panel時，往往會增加了對結果解釋的不一致性。對于一個給定的基因變異，可通過大樣本的遺傳研究以及變異蛋白的功能研究來檢測其風險。但這些風險評估往往也會產生很大的分歧。一些基因變異在人群中相當罕見，這使得很難從本質上評估其相關風險。

Domchek說，“醫療工作者使用疾病風險的解釋結果來指導病人，若未能認識到一個基因變異的真正意義，可能會帶來后續不必要或不適當的檢測或治療。我們的研究結果證實了實驗室應該主動分享數據以及對數據的解釋，這樣患者才能準確地處理這些信息，檢測供應商才能給患者提供正確的建議。”后，呼吁網上注冊平臺共享數據，應該讓醫生和患者明白差異所在，從而推動科學家以及檢測實驗室解決這些差異。

建議“實驗室應該在注冊試驗時提供更多的細節，例如他們如何得出這種解釋，這樣一來將使得差異的根源變得更加清晰。”Domchek說，“基于互聯網的登記制定對基因變異的標準化分類有重要的意義，其目的在于減少因癌癥基因檢測中錯誤信號帶來的潛在醫療傷害。”

海外醫療www.mengyiwang.com服務提供商[愛諾美康]編輯