海外醫(yī)療 基因變異到底意味著什么？

臨床實(shí)驗(yàn)室通過血液樣本來檢測(cè)基因及其變異，這種方法以驚人的速度發(fā)展，但不同實(shí)驗(yàn)室對(duì)一些基因變異的解釋卻出現(xiàn)了矛盾。研究人員近日在《Journal of Clinical Oncology》雜志上公布了調(diào)查結(jié)果，他們發(fā)現(xiàn)不同實(shí)驗(yàn)室對(duì)多達(dá)24%的變異有不同的解釋。

不同實(shí)驗(yàn)室對(duì)變異的解釋出現(xiàn)矛盾

作為該研究的引領(lǐng)者之一，賓夕法尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員對(duì)一個(gè)在線注冊(cè)列表中的基因檢測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行調(diào)查。該注冊(cè)列表名為PROMPT（Prospective Registry Of Multi-PlexTesting，多功能試驗(yàn)前瞻性登記），于2014年成立，由賓夕法尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院、Dana-Farber癌癥研究所、以及紀(jì)念斯隆凱特林癌癥中心共同創(chuàng)辦，旨在解決癌癥易感性檢測(cè)中遇到的具有挑戰(zhàn)性的問題。

研究人員選取了PROMPT注冊(cè)列表中的518組數(shù)據(jù)，其中大約95%的數(shù)據(jù)來自女性，68%被診斷為癌癥。總體來說，這些受試對(duì)象均檢測(cè)了數(shù)百種不同的基因，變異可能改變它們編碼蛋白質(zhì)的功能，從而增加患者的疾病風(fēng)險(xiǎn)。研究人員比較了不同實(shí)驗(yàn)室對(duì)603個(gè)變異的解釋，不過他們將兩個(gè)著名的癌癥風(fēng)險(xiǎn)基因BRCA1和BRCA2排除在外。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，在603個(gè)基因變異中，74%的變異在不同的實(shí)驗(yàn)室報(bào)告中有相似的解釋，但大約24%的變異在不同的實(shí)驗(yàn)室報(bào)告中有不同的解釋。大多數(shù)解釋不一致的基因變異被一些實(shí)驗(yàn)室定義為良性變異，而另外一些實(shí)驗(yàn)室認(rèn)為是意義不明變體。

更糟糕的是，對(duì)于解釋出現(xiàn)矛盾的變異，其中有36%影響了九分之一的被測(cè)試者，其中一個(gè)變異至少在一個(gè)實(shí)驗(yàn)室報(bào)告中被認(rèn)為是可能或肯定促進(jìn)癌癥的發(fā)展，但在其他實(shí)驗(yàn)室的報(bào)告中卻被視為意義不明變體。“這種差異將對(duì)患者的管理產(chǎn)生實(shí)際影響”賓夕法尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院腫瘤學(xué)教授Susan M.Domchek醫(yī)學(xué)博士說。

解釋出現(xiàn)矛盾的變異常見于CHEK2、PALB2和BRIP1腫瘤抑制基因上。

呼吁數(shù)據(jù)共享——

意義不明通常意味著該變異對(duì)基因編碼蛋白功能的影響不確定，從而對(duì)癌癥風(fēng)險(xiǎn)的影響也是未知的。從自身角度來講，對(duì)患者的管理不應(yīng)因這種變體的存在而發(fā)生變化，但在某些情況下，患者因此產(chǎn)生的焦慮足以讓其動(dòng)了接受手術(shù)的念頭，而這些手術(shù)很有可能是不必要的，例如切除完全健康的乳房。“重要的是要明白，應(yīng)該用不同的方法來對(duì)待意義不明變體與已知有害的變體”Domchek說。

當(dāng)對(duì)基因變異的風(fēng)險(xiǎn)未達(dá)到共識(shí)就將其納入基因檢測(cè)panel時(shí)，往往會(huì)增加了對(duì)結(jié)果解釋的不一致性。對(duì)于一個(gè)給定的基因變異，可通過大樣本的遺傳研究以及變異蛋白的功能研究來檢測(cè)其風(fēng)險(xiǎn)。但這些風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估往往也會(huì)產(chǎn)生很大的分歧。一些基因變異在人群中相當(dāng)罕見，這使得很難從本質(zhì)上評(píng)估其相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)。

Domchek說，“醫(yī)療工作者使用疾病風(fēng)險(xiǎn)的解釋結(jié)果來指導(dǎo)病人，若未能認(rèn)識(shí)到一個(gè)基因變異的真正意義，可能會(huì)帶來后續(xù)不必要或不適當(dāng)?shù)臋z測(cè)或治療。我們的研究結(jié)果證實(shí)了實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該主動(dòng)分享數(shù)據(jù)以及對(duì)數(shù)據(jù)的解釋，這樣患者才能準(zhǔn)確地處理這些信息，檢測(cè)供應(yīng)商才能給患者提供正確的建議。”后，呼吁網(wǎng)上注冊(cè)平臺(tái)共享數(shù)據(jù)，應(yīng)該讓醫(yī)生和患者明白差異所在，從而推動(dòng)科學(xué)家以及檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室解決這些差異。

建議“實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該在注冊(cè)試驗(yàn)時(shí)提供更多的細(xì)節(jié)，例如他們?nèi)绾蔚贸鲞@種解釋，這樣一來將使得差異的根源變得更加清晰。”Domchek說，“基于互聯(lián)網(wǎng)的登記制定對(duì)基因變異的標(biāo)準(zhǔn)化分類有重要的意義，其目的在于減少因癌癥基因檢測(cè)中錯(cuò)誤信號(hào)帶來的潛在醫(yī)療傷害。”

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