高通量方法擴展了突變影響細胞的觀點
發布日期:2022-02-23癌癥中有數百萬種突變和其他基因變異,而與無害的“乘客”相比,這些突變中的哪一個、是一個有影響的腫瘤“驅動因素”,以及每個驅動因素對癌細胞的作用,一直是一項具有挑戰性的工作。
許多研究,依賴于定制的、耗時的、特定于基因的方法,這些方法為給定突變的更廣泛的功能影響,提供了一維視角。或者,計算預測可以提供功能性的見解,但這些發現必須通過實驗加以證實。
現在一份報告中,麻省理工學院和哈佛大學博德研究所的一個研究小組,公布了一種大規模、高分辨率的方法,可以同時對大量蛋白質編碼突變進行功能性評估。
這種方法,可以返回豐富的表型信息,并有可能用于研究任何基因的任何突變癌癥,也許還有其他疾病。他們的結果,通過概念驗證實驗獲得癌細胞系,也表明個體突變不僅對其受影響的個體,有一系列的影響基因。
同時,也涉及到分子途徑和細胞整體狀態,并為長期接受的將癌癥突變分為所謂的“驅動因素”和“乘客”,增加了細微差別。“當你觀察病人腫瘤的基因數據時,你會發現,大多數與癌癥相關的突變實際上是相當罕見的,這意味著我們對這些突變的作用知之甚少,”Broad's cancer Program的杰西·博姆(Jesse Boehm)說到。