突變特征可能定義新的急性髓系亞型
發(fā)布日期:2022-02-25通過美國癌癥研究協(xié)會(huì)數(shù)據(jù),在9%的兒童急性髓細(xì)胞白血病(AML)復(fù)發(fā)病例中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的突變,可能定義了該疾病的一個(gè)新的亞型。
雖然研究人員在復(fù)發(fā)性AML樣本中發(fā)現(xiàn)了突變,但他們發(fā)現(xiàn),在許多情況下,這種突變也存在于原發(fā)樣本中,并且與定義AML突變的其他亞型相互排斥。這項(xiàng)研究發(fā)表于血癌,發(fā)現(xiàn)作者 Jeffery Klco 醫(yī)學(xué)博士,St.Jude兒童研究醫(yī)院血液病理學(xué)和分子病理學(xué)部門主任,以及St.Jude兒童研究醫(yī)院的助理教員Ma Xiaotu博士。
一個(gè)蛋白質(zhì)序列的串聯(lián)突變,通常是促進(jìn)相鄰細(xì)胞的一系列轉(zhuǎn)錄因子的突變。急性髓細(xì)胞白血病是一種相對罕見的血癌,既影響兒童也影響成人。雖然研究人員已經(jīng)確定了幾個(gè)AML驅(qū)動(dòng)因素突變,醫(yī)生用這些突變來劃分患者的風(fēng)險(xiǎn),并幫助指導(dǎo)治療決策,但大部分研究都是針對原發(fā)性癌癥進(jìn)行的。
Klco和他的同事,希望通過研究復(fù)發(fā)性AML,來識別可能導(dǎo)致復(fù)發(fā)的突變。Klco說:“這項(xiàng)研究起初只是為了了解我們在復(fù)發(fā)病例中看到的突變、與診斷時(shí)已知突變的區(qū)別。”Klco及其同事對136例復(fù)發(fā)性AML患者,進(jìn)行了全基因組測序、全外顯子測序、靶向捕獲測序和RNA測序。
他們使用來自另外417例病例的轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)的擴(kuò)展隊(duì)列,來驗(yàn)證他們的結(jié)果。他們發(fā)現(xiàn)了已知的AML驅(qū)動(dòng)因素,如KMT2A和NUP98的融合,以及一些在復(fù)發(fā)病例中富集的罕見突變。研究人員對UBTF串聯(lián)重復(fù)特別感興趣,因?yàn)樗鼈冊谒柘蛋┲泻苌俦挥^察到,而且它們在9%的患者中被發(fā)現(xiàn),這一比例相對較高。