去美國看病 基因表達的精確定量將得以應用
發布日期:2017-09-04加州大學洛杉磯分校醫學中心,建于1955年,于2008年更名為羅納德.里根醫療中心。該院位于氣候宜人華人眾多的洛杉磯,下轄8所醫院,在美國綜合排名第五,美國西海岸綜合排名第一,科研能力排名第四,先后有14人獲得諾貝爾獎,艾滋病即于1981年在該院首次發現。
去美國看病服務機構愛諾美康介紹,該醫學中心建設耗資8億美元,可抵抗里氏8級地震,被稱為“世界上技術先進的醫院”。該院新建的醫療大樓,每一層都是按照某一特定專業所需,配備整套必要的支持設備和物資。每一層都有各自的藥房、透析室、呼吸機輔助治療室和住院醫師的休息室,人性化的設計讓病人免去了奔波的疲勞。每一個病房若有需要,都可以轉換成重癥監護病房,這樣可以在同一個房間為重病人提供持續的照護。
手術室配備的是全視聽集成系統及尖端醫療設備。擁有多個創傷病房和專業CT掃描儀的一級創傷中心,使醫生一旦到達病房就能很快的知道病患出現的問題在哪。重癥監護室采用“瞄準線”切入法以確保重癥病患得到360度無死角的照護。
同一研究基于同樣的組織和芯片平臺,也會發生重復性偏低的狀況。低重復性被歸咎于芯片技術本身的特點,使用者之間的操作差異,以及數據處理過程的差異等。針對這些問題,芯片基因表達數據協會制定了一套準則“芯片實驗的小信息",這是早的一批芯片實驗準則之一,旨在為研究者或技術人員提供足夠的實驗細節,從而幫助重現公開的芯片實驗結果。
近年來,芯片實驗已經可以得到很有前景的數據,說明恰當的控制、嚴格的流程和標準的芯片分析過程能夠保證可重復的數據。基于標簽測序技術的轉錄組分析、或基因組區域,適當的計算軟件能夠給出全基因組范圍的轉錄組數據。正是這樣一個運用短序列標簽進行表達譜分析的技術,適合研究驅動基因表達和非編碼調控的轉錄調控。
然而,據估算,標簽測序只能檢測到細胞中60%的轉錄本。去美國看病服務機構介紹到,與芯片方法比較,標簽測序有機會檢測到未知轉錄本,并且能對基因表達進行單堿基分辨率的精確定量,同時背景噪聲較低。已經廣泛應用于尋找胃癌、卵巢癌和乳腺癌的生物標志物,但是它的成本是所有方法中昂貴的。
表達序列標簽是與小片段cDNA特定互補,能夠作為轉錄本應用。公共數據資源中包含了多個EST,可以通過物理圖譜技術,將這些標簽映射到特定的染色體區域。由于這些標簽明確地指向特定轉錄本,基于大規模實時轉錄組分析,通常被認為是基因表達分析中的“金標準”,這是歸功于它的檢測敏感性。隨后,技術發展檢測通量擴大,可直接應用于基因表達譜分析。
目前,常用于基因表達譜檢測的實時平臺,是利用大范圍的引物集合和探針集合,研究全基因組范圍的表達譜,在一個微流體動態微陣列中檢測超過2000個mRNA。去美國看病服務機構介紹到,檢測體系包括兩個序列特異的引物,和一個小槽結合的探針,后者包含熒光信號染料。該檢測利用聚合酶的核酸酶活性,在水解結合到目標擴增子的特異探針,提供了兩個層次的序列特異性。這個方法越來越多地應用于尋找腫瘤生物標志物,例如肝癌、黑色素瘤和膀胱細胞癌。