海外醫療：有關癌癥研究 SpUR 的新數據庫

由 KAUST 的科學家開發的交互式門戶網站，為癌癥研究人員提供了一個平臺，可以詢問基因非編碼部分的 RNA 剪接、如何促進不同類型腫瘤的生長。新資源名為 SpUR（Splicing in Untranslated Regions），可在線免費獲取，詳細介紹了 1000 多個在癌癥中常見的剪接事件。

這些剪接事件，位于蛋白質編碼終止信號下游的 mRNA 非編碼區域中。這些事件的位點和表達水平，對 10 種癌癥類型和相應正常組織的近 8,000 個樣本進行了分類和可視化。借助該工具，獨立研究團隊現在可以進一步探索個體剪接事件，在癌癥發展和進展中的作用。

“這些事件可能成為學術研究人員研究癌癥中 RNA 失調的候選者，”KAUST 計算生物科學研究中心代理副主任兼智能健康計劃副主任高鑫說。“或者，它們可以作為開發基于 RNA 的抗癌藥物的主要來源。”

計算機科學家高、博士后 Bin Zhang 和研究工程師 Adil Salhi 與新加坡癌癥科學研究所的研究人員，合作創建了 SpUR 數據庫。研究表明，基因下游序列的剪接在癌癥中普遍存在，尤其是在與腫瘤侵襲相關的基因中。

因此，癌癥攜帶更多這些基因重組事件的患者，往往具有較差的生存結果。作為原理證明，研究人員設計了稱為反義寡核苷酸 (ASO) 的剪接轉換劑，可以阻斷 3' UTR 中的這種剪接過程。當給予肝癌細胞時，這些藥物有助于抑制腫瘤生長。并且由于相同類型的剪接事件，在不同癌癥類型中普遍表達。