13 個(gè)與癌癥樣本表觀遺傳變化相關(guān)的特殊基因

根據(jù)挪威癌癥登記處的數(shù)據(jù)，截至 2020 年底，挪威有 35,515 人被新診斷出患有癌癥，超過 300,000 人已經(jīng)被診斷出患有癌癥。發(fā)展有關(guān)癌癥原因和潛在過程的知識(shí)，是一項(xiàng)重要的公共衛(wèi)生優(yōu)先事項(xiàng)。

在挪威分子醫(yī)學(xué)中心 (NCMM)，研究人員研究了 19 種癌癥類型，以確定調(diào)節(jié)異常 DNA 甲基化的潛在分子參與者，這是一種與基因表達(dá)調(diào)控相關(guān)的 DNA 表觀遺傳修飾。他們觀察到 13 種轉(zhuǎn)錄因子 (TF) 的表達(dá)與 TFBS 附近的 DNA 甲基化水平之間存在關(guān)聯(lián)，這些轉(zhuǎn)錄因子是在 TF 結(jié)合位點(diǎn) (TFBS) 與 DNA 結(jié)合以控制基因表達(dá)的特殊基因。

這 13 個(gè) TF 中的每一個(gè)，都是根據(jù)它們與至少兩種癌癥類型中 DNA 甲基化水平變化的關(guān)聯(lián)來選擇的。他們的結(jié)果，發(fā)表在表觀遺傳學(xué)和染色質(zhì)上。在人體內(nèi)，有無數(shù)的基因過程涉及我們的 DNA，以促進(jìn)健康發(fā)展。其中一個(gè)過程稱為 DNA 甲基化——一種與基因表達(dá)調(diào)控相關(guān)的機(jī)制。

異常的基因表達(dá)模式與幾種疾病有關(guān)，包括癌癥。“DNA甲基化是與基因表達(dá)控制相關(guān)的自然過程。在正常情況下，你有一定的DNA甲基化模式，但這可能會(huì)被癌細(xì)胞劫持，結(jié)果顯示出不同的（異常）模式，”研究員博士 Lemma 解釋說。

Roza Berhanu Lemma 博士是 NCMM 的研究員，Anthony Mathelier 博士的研究小組，她的同事一直在研究癌癥樣本中DNA 甲基化模式、和轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)之間的相互作用。“癌癥患者經(jīng)常報(bào)告異常的 DNA 甲基化模式，們想找出這種失調(diào)的機(jī)制是什么，并看看是否有轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)節(jié)這一過程，”Lemma 解釋說。

他們發(fā)現(xiàn)了 13 個(gè)轉(zhuǎn)錄因子，其表達(dá)水平與 DNA 結(jié)合位點(diǎn)周圍的 DNA 甲基化量相關(guān)。在這 13 種轉(zhuǎn)錄因子中，大多數(shù)是“先驅(qū)因子”，這意味著它們具有與 DNA 區(qū)域結(jié)合的特殊能力，而這些區(qū)域原本是無法進(jìn)入和甲基化的。該團(tuán)隊(duì)的發(fā)現(xiàn)，有可能導(dǎo)致更好的癌癥診斷和預(yù)后。