13 個與癌癥樣本表觀遺傳變化相關的特殊基因
發布日期:2022-07-06根據挪威癌癥登記處的數據,截至 2020 年底,挪威有 35,515 人被新診斷出患有癌癥,超過 300,000 人已經被診斷出患有癌癥。發展有關癌癥原因和潛在過程的知識,是一項重要的公共衛生優先事項。
在挪威分子醫學中心 (NCMM),研究人員研究了 19 種癌癥類型,以確定調節異常 DNA 甲基化的潛在分子參與者,這是一種與基因表達調控相關的 DNA 表觀遺傳修飾。他們觀察到 13 種轉錄因子 (TF) 的表達與 TFBS 附近的 DNA 甲基化水平之間存在關聯,這些轉錄因子是在 TF 結合位點 (TFBS) 與 DNA 結合以控制基因表達的特殊基因。
這 13 個 TF 中的每一個,都是根據它們與至少兩種癌癥類型中 DNA 甲基化水平變化的關聯來選擇的。他們的結果,發表在表觀遺傳學和染色質上。在人體內,有無數的基因過程涉及我們的 DNA,以促進健康發展。其中一個過程稱為 DNA 甲基化——一種與基因表達調控相關的機制。
異常的基因表達模式與幾種疾病有關,包括癌癥。“DNA甲基化是與基因表達控制相關的自然過程。在正常情況下,你有一定的DNA甲基化模式,但這可能會被癌細胞劫持,結果顯示出不同的(異常)模式,”研究員博士 Lemma 解釋說。
Roza Berhanu Lemma 博士是 NCMM 的研究員,Anthony Mathelier 博士的研究小組,她的同事一直在研究癌癥樣本中DNA 甲基化模式、和轉錄因子基因表達之間的相互作用。“癌癥患者經常報告異常的 DNA 甲基化模式,們想找出這種失調的機制是什么,并看看是否有轉錄因子參與調節這一過程,”Lemma 解釋說。
他們發現了 13 個轉錄因子,其表達水平與 DNA 結合位點周圍的 DNA 甲基化量相關。在這 13 種轉錄因子中,大多數是“先驅因子”,這意味著它們具有與 DNA 區域結合的特殊能力,而這些區域原本是無法進入和甲基化的。該團隊的發現,有可能導致更好的癌癥診斷和預后。