專家確定了腎細胞癌中的剪接變異生物標志物

有科學家正試圖提高他們對透明細胞腎細胞癌發展的理解，以開發新的靶向治療方法。在歐洲泌尿外科雜志上發表的一項新研究中，莫菲特癌癥中心的研究人員確定了這種疾病類型的生物標志物，并開發了一種工具，可以根據生物標志物的表達來指示哪些患者的預后不良風險很高。

透明細胞腎細胞癌是一種復雜的疾病，由不同類型的基因突變引起，包括遺傳性改變和偶發性改變。盡管有這些知識，但這些突變中沒有一個能夠用于開發有效的治療方法。為了幫助更好地了解有助于透明細胞腎細胞癌發展的關鍵分子過程，Moffitt 研究人員開始研究替代信使 RNA (mRNA) 剪接變體，以確定它們是否在這種疾病中發生改變，以及這些變體是否可以用作患者的生物標志物結果。

mRNA 是 DNA 轉化為蛋白質過程中的關鍵中間分子。DNA 在細胞核中轉化為 mRNA。然后將 mRNA 用作模板，形成控制所有細胞和生理過程的蛋白質；然而，在 mRNA 轉化為蛋白質之前，RNA 分子被剪接成不同的產物。這使得單個基因能夠編碼多種不同的蛋白質，選擇性剪接是一個自然過程，但癌細胞可以劫持該過程，以產生有助于癌癥發展和進展的剪接變體。

Moffitt 研究人員使用了一種新的篩選過程，從癌細胞系數據開始，然后用透明細胞腎細胞癌患者數據進行確認，以識別患者體內富集的剪接變體。他們確定了 16 個關鍵剪接變異，這些變異在透明細胞腎細胞癌患者中發生了改變，其中一些與疾病生物學和結果相關。研究人員還確定了幾種剪接變體與改變的 DNA 修飾模式有關。

研究人員利用這些信息，創建了一個基于五個剪接變體的組合表達水平的生存風險工具。RNASET2 和 FGD1 的表達與不良結果相關，而 PDZD2、COBLL1 和 PTPN14 的表達與更好的結果相關。該工具能夠根據總體和癌癥特異性生存的低、中和高風險對患者進行分層。

研究人員進一步分析了透明細胞腎細胞癌腫瘤樣本中的蛋白質表達模式，發現幾種負責基因剪接的蛋白質在高危患者組中的表達、和蛋白質修飾模式發生了改變。“這些結果表明，改變的剪接變體可能在透明細胞腎細胞癌的發展中發揮重要作用，并代表患者預后的生物標志物，”研究作者、泌尿生殖腫瘤學系助理成員、醫學博士 Brandon Manley 解釋說。