分子圖揭示了慢性細胞白血病的遺傳驅動因素

新構建的慢性淋巴細胞白血病 (CLL) 遺傳變化圖譜，是一種血液和骨髓癌癥，以多種形式存在并由各種原因引起，可以更好地了解這種可能導致的復雜惡性腫瘤為患者提供更準確的預后、改進的診斷方法和新的治療方法。這項工作發表在《自然遺傳學》上，由研究人員的國際合作進行，其中包括來自麻省總癌癥中心、達納-法伯癌癥研究所以及麻省理工學院和哈佛博德研究所的團隊。

CLL 以緩慢或快速生長的癌癥形式存在，并與某些基因突變有關，但尚未完全表征。以前的分析只提供了 CLL“地圖”的片段，每個都側重于特定類型的患者或有限的數據。為了更透徹地了解 CLL 及其分子亞型的生物學基礎，科學家們著手從迄今為止最大的 CLL 數據集構建地圖。

為了構建 CLL 圖，研究小組分析了來自 1,148 名患者的基因序列、基因表達模式和 DNA 化學修飾（或基因組、轉錄組和表觀基因組數據）的變異。“這樣的 CLL 圖可以在臨床中使用，其中新患者的基因組特征可以與具有相似遺傳特征的患者的治療、和結果進行比較，”共同高級和共同通訊作者 Catherine Wu 醫學博士說。

科學家們確定了 202 個基因（其中 109 個是新基因），這些基因在發生突變時可能會驅動 CLL，他們改進了具有不同基因組特征和預后的 CLL 亞型的表征。除了基因序列，某些基因的表達模式進一步細分了 CLL 并提供了有價值的預后信息。

“我們的研究表明，CLL 的遺傳和生物學情況比以前認為的要復雜得多，”麻省總癌癥中心生物信息學主任和醫學研究中心主任、共同通訊作者 Gad Getz 博士說。 患者的臨床結果與基因組、轉錄組和表觀基因組特征的組合相關，因此整合這些數據可以預測患者出現緩解、與發展為更晚期癌癥的可能性。