安德森癌癥中心：微列陣應用在臨床中有望更多

安德森癌癥中心目前擁有十個NCI優勢研究項目的資助，包括腦瘤、胰腺癌、乳腺癌、膀胱癌、前列腺癌、白血病、卵巢癌、子宮內膜癌、肺癌和黑色素瘤。每年投資超過4億美元進行醫學基礎研究，并且擁有多的美國國家癌癥研究院（NCI）資助研究項目。

中心擁有由腫瘤學家、內外科專家和護士組成的高度專業性的診療團隊，該團隊對各類的惡性腫瘤患者進行專業治療，為患者提供先進的治療方法，和參與臨床試驗的機會是安德森癌癥中心胃腸腫瘤中心的使命，提高胃腸癌癥患者的生存率和生活質量是中心的目標。研究中心專家正在努力尋找更好的治療方法，以及可以盡早檢測出胃腸癌癥的更準確的診斷和篩查手段。芯片基因組是一種DNA微陣列，用于檢測基因組拷貝數的變異，比基于染色體的比較基因組有更高的分辨率。

國外看病服務機構愛諾美康介紹到，探針和靶標可以通過測量熒光標記靶標。在微陣列中，探針合成后通過共價鍵結合在固相載體表面，比如玻璃或硅。芯片平臺采用微珠代替大的固相載體，用于結合探針。微陣列也可以通過把寡核苷酸，直接合成在固相載體表面來構建。微列陣技術不僅用于基礎研究，而且也用于病人管理。

到目前為止，兩個微列陣分析已被FDA批準應用于臨床。第一個是基于芯片分析針對乳腺癌病人進行個性化治療。它為61歲以下的女性淋巴結陰性乳腺癌患者提供了一個預后分析。該分析方法可以檢測70個基因的表達，包括調節細胞增殖和侵襲、轉移、基質完整性和血管生成的相關基因。第二個是檢測基因芯片，用于細胞色素基因的分型，它能指導醫生選擇有效且副作用小的藥物。其使用的基因芯片檢測193個等位基因，來確定是否具有兩個基因型中的一個。檢測27個等位基因來確定其是否具有四個基因型中的一個，從而對不同個體進行分類。

盡管微列陣技術是一個對基因表達，和基因分型分析強有力的工具，但是它的可靠性和重復性受到質疑。微列陣在不同的實驗平臺和實驗室結果，有時會有顯著不同，且重復性比較低。這種不可重復性可能是列陣的獨特性，不同個體差異性以及應用的不同統計方法造成的。微列陣的第一個行業標準，是通過基因芯片表達協會公布的，即“微列陣實驗的小信息”。標準制定的目的就是提供足夠多的實驗細節，以便使得其他研究人員或技術人員能夠重復出，已發表的基因微列陣得到的實驗結果。可接受的重復性，可以通過使用適當的對照和遵循嚴格的程序以及標準實現。

國外看病服務機構愛諾美康介紹到，在不久的將來，微列陣技術有望在臨床實踐中應用得越來越多。直接DNA測序和下一代測序桑格DNA測序技術，是一種基于酶反應的技術。它采用DNA聚合酶在三磷酸脫氧核苷酸，存在時延伸寡核苷酸引物進行反應。關鍵原理在于除了三磷酸脫氧核苷酸外，還引人了三磷酸來終止DNA鏈的合成。

安德森癌癥中心轉診機構愛諾美康介紹，一個被合成到延伸中的DNA鏈上后，由于缺失進一步的延伸反應無法繼續，從而阻止了后續形成磷酸二酯鍵。這樣的終止法需要一個單鏈的DNA模板引物。每種三磷酸雙脫氧核苷酸，都被標記上不同的熒光染料。測序反應和毛細管電泳完成后，不同染料標記的DNA片段形成階梯狀，可以由自動化測序儀進行檢測。