利用單細胞測序揭示卵巢癌和乳腺癌的相關過程

來自威爾康奈爾醫學院、不列顛哥倫比亞省癌癥研究中心和紀念斯隆凱特琳癌癥中心的一組研究人員與IMAX聯盟的一個小組合作，利用單細胞測序揭示了乳腺癌和卵巢癌相關的突變過程。

在《自然》雜志上發表的論文中，該小組描述了他們如何對數千個乳腺組織細胞進行單細胞基因組測序，并將他們的發現與對數千個卵巢和乳腺腫瘤細胞樣本進行測序進行了比較。

研究人員在注意到可能引發各種癌癥基因組不穩定的細胞間拷貝數改變后開始了他們的研究，研究界尚未很好地解決這一問題。他們還指出，在不同類型癌癥的進化過程中，這種改變可能導致表型變化的方式也沒有得到充分研究。為了糾正這種情況，該團隊開展了一項雄心勃勃的測序工作，直接地關注與卵巢癌和乳腺癌相關的突變過程。

團隊的工作是雙管齊下的。其中一項工作涉及對13800個乳腺上皮細胞進行單細胞基因組測序，這些細胞來自可能或可能沒有腫瘤蛋白p53或乳腺癌1型或2型易感蛋白突變導致同源重組缺陷的女性。他們通過觀察單倍型模式和單細胞結構變異來尋找相互作用的過程。另一項工作涉及對22057個晚期卵巢癌或乳腺癌腫瘤細胞進行單細胞基因組測序。然后，他們將第一次嘗試中發現的模式（他們稱之為前景事件）與第二次嘗試中的模式進行了比較。

在他們的比較中，研究人員發現了他們所描述的拷貝數和結構改變的細胞變異，這些變異在三陰性乳腺癌和高級別嚴重癌癥中普遍存在，這些癌癥在獨特的不穩定過程中可見。他們進一步表明，這種改變表明對數百個基因的表達水平有影響。