出國看病:預測結腸癌患者化療益處的生物標志物
發布日期:2024-08-23許多2期或3期結腸癌患者在手術后接受額外的或輔助的化療。然而,臨床試驗表明,這種治療并不能提高每個患者的生存機會。
邁阿密大學米勒醫學院西爾威斯特綜合癌癥中心的研究員陳士駿博士正在利用他的數據專業知識來幫助解決這個問題。他領導了一項發表在《細胞報告醫學》上的研究,該研究確定并驗證了一種10基因生物標志物,該生物標志物可能預測2期或3期結腸癌患者是否將受益于輔助化療。這一發現為進一步的研究奠定了基礎,有朝一日,這一研究將允許患者和他們的醫生做出個性化的治療決定。
“當你談論精確腫瘤學時,這意味著你使用單個患者的信息——這里我們特別談論的是來自患者的生物標志物——來指導醫生做出臨床決定,確定哪種治療對患者最合適,”陳博士說。“理想的情況是,我們只想對將從中受益的患者進行輔助化療。對于沒有反應的患者,我們仍然需要找到其他有效的治療方法。”
作為一名數據科學家,米勒學院公共衛生科學系生物統計學教授陳博士將機器學習和人工智能應用于癌癥研究,主要專注于結腸癌和乳腺癌。科學家們此前發現了一些生物標志物,可以幫助醫生預測患者的生存曲線或了解癌癥的侵襲性。陳博士說,
這些是有用的,但無助于指導治療。因此,他和他在范德比爾特大學和紀念斯隆-凱特琳癌癥中心的合作者開始尋找一種基因簽名——一組特定的基因,其組合表達模式可以作為生物標記——這可能。“這對我們來說是一個真正的動力,”陳博士說。
結腸癌患者的腫瘤有許多不同的基因組圖譜,因此該團隊匯總了來自六個公開來源的基因表達譜,創建了一個933名患者的數據集,使其成為2期和3期結腸癌最大的基因表達數據集之一。陳博士說,該團隊的數據科學家精心策劃和執行質量控制,以確保他們能夠識別準確的基因簽名,以預測對化療的反應。