去美國看病 探針越短越有助于檢測基因改變
發布日期:2018-02-23在比較基因組雜交技術發明之前,染色體核型分析和熒光原位雜交(FISH)技術,常分別用于檢測染色體及局部特異性位點的改變。核型分析是對分裂中期染色體進行吉姆薩染色,通過觀察染色體G顯帶特征,來分析染色體重排。去美國看病后,FISH法是利用局部特異性探針,來識別特定DNA片段的缺失、擴增和易位。
染色體涂染技術和光譜核型分析技術,拓展了FISH方法,從而可同時檢測多條染色體或多個染色體片段。aCGH技術是一種“反向熒光原位雜交”,其探針置于載體上而樣本被標記。同時它也是一種“競爭雜交”。去美國看病服務機構愛諾美康介紹到,在基因芯片發明之前,比較基因組雜交,以平鋪于玻片上的正常細胞分裂中期染色體,作為競爭性雜交的靶點。
第一代全基因組aCGH技術平臺,將DNA克隆片段固定于芯片的微陣列上來,研究基因組中特定的靶序列,例如Pollack及其同事報道了以3360個cDNA制作的CGH芯片。Snijders等應用含有0.1Mb人類DNA片段的細菌人工染色體(BAC)及其他克隆,研究2460個位點的拷貝數變化?;谌祟惢蚪M物理圖譜發展起來的嵌合芯片,可覆蓋整個基因組。
去美國看病服務機構愛諾美康介紹到,小于兆堿基的嵌合芯片(SMRT),首次涵蓋了人類的全基因組,由32433個BAC克隆構成,每個靶點重復點樣3次BAC克隆的重疊式排列,使得檢測標記克隆之間的序列改變的操作不需再做。SMRT芯片技術可檢測>80kh的DNA拷貝數變化,高密度芯片的應用,增加了CGH芯片的分辨率,寡核苷酸探針是一類含有25~80個核苷酸的序列,將aCGH含有1000000個探針。去美國看病為了同時獲得拷貝數,及等位基因的信息,人全基因組Affymetrix SNP6.0芯片目前已實現商品化。
去美國看病后應用的每一種技術平臺,都擁有其特殊的芯片制作技術,而Illumina BeadChip技術將寡核苷酸探針固定在微珠表面,佳寡核苷酸探針的長度,視不同的技術平臺而定。每組探針都由25mer的探針對構成,識別待測樣本是完全匹配還是堿基錯配。
Agilent和Illumina平臺使用50?60mer的寡核苷酸探針,以達到高靈敏度。去美國看病值得注意的是,芯片的分辨率并不是依賴于芯片成分的長度,比如含25mer芯片成分的分辨率并不是25hP,而是依賴于探針的密度和分布,探針越短越有助于檢測到小的基因改變。