去美國看病 普通實體腫瘤是異質(zhì)性組織
發(fā)布日期:2018-02-15臨床研究上,位點特異的DNA測序,是以PCR為基礎(chǔ)的方法,這在大多數(shù)的分子診斷實驗室,經(jīng)常用來檢測許多已知的基因突變。例如,在結(jié)直腸癌、肺癌、黑色素瘤、膠質(zhì)母細胞瘤中的癌基因KRAS、BRAF或EGFR中頻繁或熱點突變。去美國看病后,基因或位點特異的外顯子片段,可以通過PCR擴增和DNA測序方法進行。
雙脫氧鏈終止DNA測序(也稱為Sanger測序),是傳統(tǒng)的測序方法,而且也是近常用的測序方法。然而,在豐富的野生型的DNA序列為背景的情況下,它可能無法檢測到少數(shù)的突變序列。去美國看病服務(wù)機構(gòu)愛諾美康介紹,實體腫瘤是異質(zhì)性的組織,該組織中包含有腫瘤細胞和非腫瘤細胞,包括炎性細胞、血管內(nèi)皮細胞和間質(zhì)細胞。
檢測癌基因獲得功能突變,對我們來說是一個特別挑戰(zhàn),如KRAS。不僅在腫瘤組織中,每個非腫瘤有兩個野生型的等位基因,而且每個腫瘤細胞可能也有它自己的一個副本野生型等位基因。去美國看病后,大規(guī)模并行測序,即我們所知的“焦磷酸測序”,可作為Sanger測序的一種新的替代方法。
這種方法需要將“DNA文庫”,進行基于PCR的微乳滴克隆擴增,以適應(yīng)光纖載板(picotiter plate)中每個克隆擴增模板的微米大小,珠子和后續(xù)焦磷酸的邊合成邊測序。去美國看病采用這種焦磷酸測序方法,可以檢測含腫瘤組織較少的復(fù)雜樣本,及低豐度的基因突變。這是傳統(tǒng)的Sanger測序無法檢測的,高度平行測序的方法,使檢測腫瘤的分子組成和亞型進化過程成為可能。即使是在腫瘤含M較低或不純的病例中,可以采用使細胞含量豐富的方法。
去美國看病服務(wù)機構(gòu)愛諾美康介紹,焦磷酸測序主要是一種克服傳統(tǒng)測序局限性的技術(shù),它是實時的、非電泳、堿基延伸測序的各種應(yīng)用。在焦磷酸測序中,只有當(dāng)分配核苷酸退火模板,和DNA聚合酶延伸引物時,焦磷酸鹽才形成。隨后,焦磷酸轉(zhuǎn)換為熒光發(fā)射,其強度與退火和延伸的核苷酸分子的數(shù)成正比。焦磷酸測序法在檢測單核苻酸多態(tài)性時,可以非常準(zhǔn)確地M化各等位基因的相對量。