出國治療 如何評估芯片完整性及樣品質量

臨床研究上證明，基因芯片由成千上萬個DNA探針，以預知的模式固定在基片上，或固定在磁珠上而隨機分布在芯片上。基因表達陣列可檢測熒光標記的cDNA片段，而比較基因組雜交陣列（aCGH），可檢測熒光標記的基因組DNA片段。出國治療后，由于基因芯片檢測平臺的復雜性和多變性，必須在臨床實驗室使用之前和使用中驗證其性能。

任何基因芯片平臺的重復性，應在臨床使用之前得到驗證，而且重復性驗證通常由不同技術人員在不同吋間完成。比如，如果一種RNA表達模式，用于對患者分層成不同的預后群，即使在不同時間進行分析，相同的樣品應該分到同樣的群組里。出國治療用一個基因芯片，檢測大M基因的表達水平，或鑒定基因拷貝數的改變時，在不同的批次檢測中應當獲得相同的表達水平，或基因拷貝數的改變。

出國治療服務機構愛諾美康介紹到，當驗證一個基因芯片檢測平臺的檢測性能準確性時，由于探針設計、用于標化的管家基因的選擇、標化技術等各方面存在的差異，利用其他表達芯片或qPCR進行驗證可能會得到不一樣的結果。當驗證小片段缺失或是較好的性能的FISH探針時，即使利用作為“金標準”的FLSH驗證，比較基因組雜交陣列（aCGH）平臺的準確性，也可能得到不一樣的結果。

當為基因芯片平臺設計準確性研究時，還需確認所用的兩種技術或平臺的標準化手段，或檢測敏感性是相當的。在進行表達分析之前，應先檢測所用RNA樣品的質量。出國治療對于表達芯片，通常是利用RNA完整性值（RIN），來評估樣品中RNA的質量。高RIN樣品中比RIN低的樣品，通常含有更完整的RNA。

開展基于cDNA合成時結合，在poly-A的轉錄本的芯片分析實驗時，樣品中的RIN數量對于檢測的成功至關重要。出國治療后發現，然而也有些基因芯片平臺，設計成了可以精確 定量已降解的轉錄子，所以樣品中的RIN，對樣本性能的影響微乎其微。