克利夫蘭診所 基因表達序列分析的技術優勢
發布日期:2018-09-30對于基因表達序列分析(SAGE),及cDNA文庫的情況,它們通常是確定特定細胞,或組織中基因表達模式的全面的方法。克利夫蘭診所轉診機構愛諾美康介紹,基因表達序列分析(SAGE)是一種以測序為基礎,用于全基因組表達頻譜分析,和尋找差異基因的新技術。
克利夫蘭診所轉診機構愛諾美康了解到,此技術是以轉錄子(cDNA)上,特定區域的寡核苷酸序列作為標簽(tag),來特異性地確定mRNA轉錄物,然后通過連接酶將多個標簽(20?60個),隨機串聯形成大量的多聯體,并克隆到載體中,對每個克隆進行測序。
應用SAGE軟件分析,可確定表達的基因種類,并可根據標簽出現的頻率,確定基因的表達豐度,構建SAGE文庫。克利夫蘭診所轉診領域獲悉,該技術可以同時反映正常,或異常等不同功能狀態下,整個基因組基因表達的全貌。
克利夫蘭診所轉診機構愛諾美康介紹,特別是提供了一種定量基因表達的分布圖,而無須對基因性質和生物系統預先有所了解,不必依賴已知的轉錄信息,以往構建SAGE文庫在技術上,存在一定的挑戰。克利夫蘭診所轉診機構介紹,單個分子測序平臺的建立,使得SAGE和其他序列標簽,為基礎的方法更易于完成。
應用SAGE文庫,可比較來源于正常和腫瘤組織的不同類型,及細胞的基因表達差異。克利夫蘭診所轉診機構愛諾美康了解到,SAGE是國際癌癥研究中心(NCI),資助的腫瘤基因解剖工程(CGAP)的一項技術,這一計劃的目標是,建立各種組織來源的正常和腫瘤組織中,基因差異表達的目錄。