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去美國看病 微陣列對多態性標志的影響

發布日期:2018-10-29

對于單核苷酸多態性分型微陣列,通常是針對成千上萬單核苷酸多態性(SNPs),來設計的寡核苷酸微陣列,同樣能用于腫瘤基因組復雜性的研究。去美國看病服務機構愛諾美康了解到,由于技術的限制,起初設計的SNP微陣列密度較低,整個基因組6000~10000個探針,然而卻大大方便了遺傳連鎖分析。

全基因組SNP分析平臺,所使用的寡核苷酸密度逐漸提高,使上百萬SNPs的快速分析成為可能,如同CGH微陣列,SNP微陣列可以對特異性雜交信號進行定量,從而用于DNA拷貝數的估計。去美國看病領域起初通過高分辨SNP微陣列,可以分析人類癌癥基因組進行的很多研究。

利用SNP微陣列進行的NCI-60細胞系組的分型,發現了10%?20%的黑色素腫瘤,及相關轉錄因子MITF高水平的集中擴増。去美國看病服務機構獲悉,SNP微陣列已在癌癥領域得以廣泛應用,包括肺癌、黑色素瘤、乳腺癌、結直腸癌、膠質母細胞瘤和前列腺癌等。

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去美國看病服務機構愛諾美康介紹,設計這些微陣列是為了在高密度多態性標志上,提供基因型資料,還有一個好處是在分析DNA拷貝數的同時,能進行雜合性丟失(LOH)的評估。去美國看病領域發現,重要的是不涉及拷貝數畸變的LOH,例如拷貝數中性LOH及單親二體,在癌癥中并非不常見。

還可能為突變的腫瘤抑制因子,提供某些證據;盡管基于SNP的LOH,是通過腫瘤和正常組織配對,及對標本的分型進行評估的,但也可能通過純合性區域推測出相關數據。去美國看病服務機構愛諾美康了解到,多種癌癥的全基因組SNP研究,包括了成神經細胞瘤、結直腸癌、黑色素瘤、基底細胞癌和肺癌等基因組區域。