低級別的膠質瘤通常具有高度特異性

曾有海外數據報道，一些GSC細胞株中的表達下降，對神經母細胞瘤中MAGE-A1、MAGE-A3和NY-ESO-1表達上調，也會產生影響，并能促進細胞毒性MAGE-A3。而黑色素瘤相關抗原3T細胞，其介導的腫瘤細胞殺傷，也與膠質瘤相關。

對于前列腺干細胞抗原特征、潛在功能GBM高表達，也常與早期神經元性蛋白MAP2和PID-微管蛋白（而非成熟的神經元性標志物NeuN）共表達。并且，GPI錨定的細胞表面蛋白，也代表了一個新的GAA。

同時，它還表達于膠質瘤和黑色素瘤，其所有類型的膠質瘤，也均表達SOX10。而與高級別的膠質瘤相比，低級別的膠質瘤sox10分布，更為廣泛。

部分轉錄因子SOX11，在人惡性膠質瘤中，則具有高度特異性的過表達。

研究報道，對人膠質瘤具有一定的預后價值中，高級別的膠質瘤UPAR和組織蛋白酶B，也會過表達。它與癌的侵襲表型高度相關，且在膠質瘤中過表達一個轉錄因子替莫唑胺。

之后又有專家發現，一個較強的有絲分裂信號模序（刺激EGFR），在惡性膠質瘤的進展中發揮了重要作用：50%?60%的膠質瘤過表達EGFR，24%?67%的膠質瘤表達大部分常見的突變型EGFRvBI。

多變量分析顯示，EGFRvffl的出現與生存率下降相關，而且加強了惡性細胞對放療和化療的抵抗，這都說明，EGFRvlD與惡性膠質瘤之間存在功能相關性。