深入研究腫瘤組織，才能找到更好地治療方式

當前臨床，醫生通過從患者身上采集組織樣本來診斷癌癥，他們通常將這些樣本，固定在福爾馬林中進行顯微鏡檢查。在過去的20年中，還建立了遺傳方法，可以更詳細地表征腫瘤中的突變，從而幫助臨床醫生選擇最佳治療策略。

即使是微小的組織樣本，也可用于檢測蛋白質。來自亥姆霍茲協會（MDC）的柏林MaxDelbrück分子醫學中心、柏林衛生研究所（BIH）、柏林慈善大學和德國癌癥協會（DKTK）的一組研究人員，成功地分析了使用質譜儀、詳細分析固定肺癌組織樣本中的8，000多種蛋白質。

“使用我們開發的方法，可以在蛋白質水平對癌細胞的分子過程進行深入分析，并在日常臨床實踐中大量收集、和存儲的存檔患者樣本中進行分析，”MDC和BIH蛋白質組學平臺負責人PhilippMertins博士說。“即使是非常小的組織樣本，例如通過穿刺活檢獲得的組織樣本，也足以進行我們的實驗。”

該研究發表在《自然通訊》雜志上，被認為是多模態臨床質譜靶向治療抗性（MSTARS）研究項目的重大成功，該項目由德國聯邦教育和研究部（BMBF）資助。由Mertins和Charit病理學研究所的FrederickKlauschen教授領導的研究小組，已經能夠證明，與經常研究但非常敏感的RNA分子不同，蛋白質在樣品中保持穩定多年，并且可以精確地量化。

“此外，存在于腫瘤組織中的蛋白質，尤其能很好地映射疾病進展，”主要作者、博士生科琳娜·弗里德里希（CorinnaFriedrich）說。Mertins和Klauschen實驗室的學生，“這是因為它們提供了一些信息，例如哪些促進或抑制腫瘤生長的基因在細胞中特別活躍。”

這些方法，有望幫助確定每種腫瘤的最佳治療方法。從該團隊對兩種肺癌——腺癌和鱗狀細胞癌的分析中，獲得的圖片也變得如此詳細，因為研究人員不僅發現了細胞中存在的大量蛋白質，而且還量化了超過14，000磷酸鹽。

在磷酸化的幫助下，磷酸化是一種調節磷酸基團、與蛋白質可逆連接的機制，細胞通過打開或關閉某些信號通路，來控制幾乎所有的生物過程。

“因此，我們的論文為更好地了解肺癌、和其他類型癌癥的疾病進展提供了良好的基，”Klauschen說，他與Mertins是該研究的共同通訊作者。他說，這將使為每位患者，找到最佳治療方案變得更加容易。

Mertins還希望，對組織樣本中蛋白質組的質譜分析，不僅為發現用于治療決策和患者生存預測的新生物標志物鋪平道路，還為發現可作為未來藥物靶點的其他分子結構鋪平道路。而且，根據研究人員的說法，新方法還有另一個優點：“我們的方法不僅適用于研究癌癥，而且可以非常廣泛地應用。”

例如，蛋白質組學平臺已經成功分析了來自COVID-19患者的固定免疫細胞的蛋白質組。作者還提供了哪些質譜方法，最適合不同類型臨床研究的指南。

MDC平臺的下一個議程是，對額外的固定免疫細胞和固定心血管組織進行質譜分析，以確定是否存在蛋白質和磷位點。“這里的目的是，更好地了解傳染病和心血管疾病，”默廷斯解釋說，“這樣有一天可能會，以比迄今為止更好的方式治療這些疾病。”