全面的臨床測序為精準醫療打開了大門
發布日期:2021-08-14近日,St.JudeChildren'sResearchHospital的研究人員已經證明,對所有兒科癌癥患者進行全面的基因組測序是可行的,并且對于利用精準醫療的救生潛力至關重要。圣裘德兒童基因組研究的結果今天在線發表在癌癥發現雜志上。
向所有309名參加該研究的患者提供了生殖系DNA的全基因組和全外顯子組測序,對253名可獲得足夠腫瘤樣本的患者,進行了腫瘤DNA的全基因組、全外顯子組和RNA測序。
總體而言,86%的患者在腫瘤或種系DNA中至少有一種臨床顯著變異。這些包括與診斷、預后、治療或癌癥易感性相關的變異。研究人員估計,五分之一的患者具有使用標準測序方法無法檢測到的臨床相關突變。
“一些更具臨床相關性的發現之所以成為可能,是因為該研究將全基因組測序與全外顯子組和RNA測序相結合,”圣裘德計算生物學系主任、該研究的共同通訊作者JinghuiZhang博士說。學習。
每個腫瘤都是獨一無二的。每個患者都是獨一無二的。包括全基因組、全外顯子組和RNA測序在內的綜合臨床測序尚未廣泛應用。但隨著這項技術變得越來越便宜,越來越多的患者可以使用,研究人員表示,綜合測序將成為兒科癌癥護理的重要補充。“我們希望改變該領域的思維方式,”該研究的合著者、St.JudePrecisionGenomics團隊主管DavidWheeler博士說。“我們展示了在患者層面使用基因組數據的潛力,即使在常見的兒科癌癥中,每個腫瘤都是獨一無二的,每個患者都是獨一無二的。
“這項研究顯示了識別腫瘤脆弱性,并學習利用它們來改善患者護理的可行性,”他說。腫瘤測序指導了78名研究患者中12名標準護理不成功的治療改變。在12名患者中的4名中,這些變化穩定了疾病并延長了患者的生命。另一名患有急性髓性白血病的患者病情有所緩解,并通過造血干細胞移植治愈。
“通過這項研究中的全面基因組測試,我們能夠清楚地識別出可以用靶向藥物治療的腫瘤變異,為腫瘤學家如何管理他們的患者打開了大門,”共同通訊作者KimNichols醫學博士說,圣裘德癌癥中心易感科主任。