新的計算工具可解釋癌癥突變的臨床意義
發布日期:2022-05-31費城兒童醫院的研究人員,已經開發出一種新的工具,來幫助研究人員解釋體細胞突變在癌癥的臨床意義。工具被稱為CancerVar,結合機器學習框架,超越僅僅識別癌癥突變體細胞和解釋這些突變的潛在意義。
“CancerVar不會取代人類臨床,但它將大大減少人類評論者的手工工作、分類變量,可確定通過測序和起草精密腫瘤臨床實踐的報道,”王博士說。“CancerVar文件和協調各種類型的臨床證據,包括藥物信息、出版物和體細胞的途徑突變。通過提供標準化的、可再生的和精確的輸出,解釋體細胞變異,CancerVar可以幫助研究人員和臨床醫生關注其優先突變。”
下一代測序的增長和精密醫學,可導致數百萬癌癥體細胞變異的識別。為了更好地理解這些突變,是否有關或影響疾病的臨床過程,研究人員建立了幾個數據庫,包括變異目錄。
然而,這些數據庫沒有提供標準化的體細胞變異的解釋,所以在2017年,分子病理學協會(AMP),美國臨床腫瘤學會(ASCO)和大學的美國病理學家(CAP),共同提出了解釋標準和指導方針,報告分體細胞的變異。