海外醫療:PCR是用來擴增特異DNA分子的手段
發布日期:2017-09-15作為歐洲好的心臟病專科醫院,英國皇家布朗普頓醫院是早使用生物可降解支架的醫院,是生物可降解支架植入術成功率高的醫院。醫院在2005年即在臨床使用生物可降解支架,是英國首個為病人使用生物可降解支架的的醫療中心,至今擁有七年的應用歷史。作為英國好的心肺專科醫院,同時也是英國大的心臟病和肺病??漆t院,擁有1600多名員工,5個手術室和4個導管實驗室。
海外醫療機構愛諾美康了解到,在核酸的檢測上,幾十年來,Southern和Northern印跡使用放射性同位素或熒光標記的探針進行了DNA和RNA的分析。然而,由于這些技術費時費力,并且需要大量的DNA/RNA,在臨床實驗室中用的越來越少。DNA/RNA的靶標和信號放大,是目前腫瘤分子診斷分析使用的兩種主要技術。靶標放大的例子有PCR、連接酶鏈式反應,基于轉錄的擴增系統和鏈置換擴增,信號放大的例子有支鏈DNA,雜合捕獲和入侵信號放大。原位雜交或顯色原位雜交,是用于分子腫瘤學領域的另一個重要的技術,因為它是在腫瘤形態學的基礎上進行的。
目前,常用的對臨床標本進行分析的分子生物學技術是基于PCR和原位雜交的檢測。此外,DNA/RNA微陣列,經過多年臨床前實驗驗證,已開始被用于臨床實踐中。下一代測序(NGS),作為一組新興和強大的分子生物學工具,雖尚未被用于臨床,但不久就會因其高精度、大規模處理能力和相對較低的成本而被應用于臨床。
海外醫療機構愛諾美康了解到,聚合酶鏈式反應PCR,是用來擴增一段特異DNA的分子技術手段,以便分析遺傳變異。一個基本的PCR需要以下幾個成分:①一段DNA模板,也即用來擴增的目的序列;②一對引物,目的DNA序列的正義鏈和反義鏈分別互補的一段序列;③DNA聚合酶,適合的擴增溫度在70丈左右;④dNTP,DNA合成過程需要的原料;⑤適合DNA聚合反應的緩沖液。
PCR反應通常在熱循環儀中,以25~504反應體積進行熱循環儀即PCR儀。市售的來自不同制造商的各種PCR儀器可見是臨床實驗室常用的。DNA模板上,通常引物的退火溫度比引物溶解溫度低3~5尤;③延伸步驟通常是在72~75丈,對大多數用于合成新DNA的DNA聚合酶都適合的溫度范圍;④后一個延伸循環步驟,通常是72丈10min,確保單鏈DNA能夠完全延伸;⑤后一個短暫保存循環通常在4~15。
PCR產物也叫做擴增子,通常通過電泳、雜交、酶切以及測序來進一步檢測,DNA電泳檢測根據DNA片段的大小通過一定的黏性介質來分離,例如瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠。瓊脂糖通常用來分離較大片段的DNA分子,而聚丙烯酰胺凝膠用來分離較短DNA片段或需要得到更高分辨率。
熱循環儀器在反應的每個步驟中需要對反應管進行加熱和降溫。典型步驟如下:①DNA變性步驟通常在94~98,20~30s使得DNA變成單鏈;②50?65T退火20?40秒使得引物結合到單鏈。凝膠電泳結束后,DNA片段用一種熒光染料染色,例如溴化乙啶(EB),然后在紫外燈下成像。
毛細管電泳用310/3100可以達到更高的分辨率,可以檢測到小3個堿基的差異。海外醫療機構愛諾美康了解到,通過毛細管凝膠電泳分析擴增子,通常需要預先對引物用熒光染料標記。擴增子還可以通過與探針雜交檢測,例如斑點雜交。為了檢測點突變,擴增子可以通過內切酶酶切,因為點突變通常會造成 增加或改變一個酶切位點。