腫瘤代謝圖譜為發現癌癥機制提供了新途徑
發布日期:2023-08-15根據威爾康奈爾醫學和紀念斯隆-凱特琳癌癥中心大學的研究人員的說法,一個記錄腫瘤樣本中基因活動和被稱為代謝物的小分子水平的圖譜提供了一種識別癌癥深層機制的新方法。
研究人員將他們的工作發表在6月19日的《自然代謝》雜志上,通過結合新的和現有的代謝物和基因活動數據集,創建了癌癥代謝圖譜(CAMP)。該圖譜包含來自11種不同癌癥類型的988個腫瘤和正常組織對照樣本的數據。科學家們對數據的分析揭示了兩大類基因代謝物的聯系,指出了各種癌癥類型的工作機制。
“這個新的圖譜將有助于我們建立對腫瘤如何發揮作用的核心理解,”該研究的共同高級作者Jan Krumsiek博士說,他是生理學和生物物理學助理教授,也是威爾康奈爾醫學中心Sandra and Edward Meyer癌癥中心的成員。
“我們的工作解決了代謝物水平和基因表達水平的變化如何協調的基本問題,”另一位研究共同資深作者,紀念斯隆-凱特琳癌癥中心大學的計算生物學家Ed Reznik博士說?!拔覀兘o出的答案是美麗而微妙的:這種協調是由遺傳編碼的酶及其代謝物底物的分子作用以及腫瘤微環境中代謝獨特的免疫細胞的存在共同產生的?!边@項研究的共同第一作者是Elisa Benedetti博士,他是Krumsiek實驗室研究期間的研究助理;研究人員Eric Liu博士和當時在Reznik實驗室的研究生Cerise Tang博士。