基因篩選使細(xì)胞中遺傳程序的精確反向工程成為可能

由Dana-Farber/波士頓兒童癌癥和血液疾病中心的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的合作研究定義了一種新的方法，以了解某些稱為轉(zhuǎn)錄因子的蛋白質(zhì)如何決定哪些遺傳程序?qū)Ⅱ?qū)動細(xì)胞生長和成熟。

這種方法被稱為“Perturb-multiome”，使用CRISPR一次敲除許多血細(xì)胞中單個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的功能。然后，研究人員對每個(gè)細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞分析，以測量編輯的效果，包括識別哪些基因已經(jīng)打開或關(guān)閉，哪些基因是可訪問的(基于表觀遺傳標(biāo)記)。

該團(tuán)隊(duì)將這一工具應(yīng)用于未成熟的血細(xì)胞，以確定重要的轉(zhuǎn)錄因子——以及編碼它們的DNA區(qū)域——這些轉(zhuǎn)錄因子強(qiáng)烈影響血細(xì)胞的發(fā)育。他們發(fā)現(xiàn)，他們認(rèn)為對推動血細(xì)胞生成很重要的許多DNA區(qū)域，也是已知含有與血液疾病相關(guān)的突變的區(qū)域。他們確定為重要的DNA區(qū)域占基因組的不到0.3%，但他們解釋了對血細(xì)胞特征和特化的不成比例的大部分遺傳影響。