IHC檢測可作為NGS的替代品,用于早期檢測TP53突變MDS/AML
發(fā)布日期:2025-09-08根據(jù)發(fā)表在《癌癥》上觀察性試驗(yàn)(NCT01174615)數(shù)據(jù),免疫組織化學(xué)(IHC)可作為骨髓增生異常腫瘤(MDS)和急性髓系白血病(AML)患者TP53突變早期檢測及TP53等位基因狀態(tài)預(yù)測的生物標(biāo)志物,且在特定條件下有較高應(yīng)用價(jià)值,但目前還不能完全取代下一代測序(NGS)檢測。
具體研究結(jié)果
不同病癥樣本染色陽性細(xì)胞百分比
可評估樣本(n = 145)中,AML樣本染色陽性細(xì)胞平均百分比為28%(±3.67%),MDS樣本為8.8%(±1.61%)(P < 0.001)。
MDS亞群中,多基因TP53突變的p53染色陽性細(xì)胞平均百分比為10.7%(±1.96%),單等位基因TP53基因突變?yōu)?.44%(±0.49%)(P = 0.010)。
AML亞組中,多基因TP53突變和單等位基因TP53基因突變的比率分別為29.6%(±3.67%)和0%(±0%)(P = 0.034)。
IHC和NGS相關(guān)性
整個(gè)隊(duì)列特異性為96.3%,MDS樣本為95.5%,AML樣本為100%;整個(gè)隊(duì)列IHC敏感性為76.3%。
IHC陽性與TP53變異等位基因頻率(VAF)有相關(guān)性(R2 = 0.228)。
IHC作為NGS替代品的優(yōu)勢
IHC檢測更具成本效益且更易獲得,是NGS有吸引力的替代方案,尤其適用于全球市場和醫(yī)療保健不平等的地區(qū)。
患者分類與相關(guān)性
根據(jù)ICC定義的多重命中狀態(tài)將患者分類,發(fā)現(xiàn)MDS與單等位基因敲除和多敲除TP53突變呈正相關(guān);具有多基因TP53突變的AML相關(guān)性較弱但仍呈正相關(guān);無法評估具有單等位基因TP53基因突變的AML的相關(guān)性(僅3名患者屬于此亞組)。
p53 IHC閾值相關(guān)
p53 IHC閾值為7%,對MDS和AML中的多發(fā)性TP53[突變]具有100%的陽性預(yù)測價(jià)值,精確召回曲線下的面積為0.958[95%置信區(qū)間,0.930 - 0.979]。
假陰性檢測情況
28次假陰性檢測樣本的TP53 VAF變異性高,平均VAF為27.9%(SD,26.7%);75%的假陰性發(fā)生在多靶點(diǎn)TP53患者中,25%發(fā)生在單等位基因突變患者中。
單一無義或移碼突變會導(dǎo)致p53 IHC檢測假陰性;在至少有2個(gè)TP53突變的樣本中,僅在至少有1個(gè)錯(cuò)義突變的病例中報(bào)告IHC陽性,14.3%的錯(cuò)義突變導(dǎo)致假陰性結(jié)果,85.7%通過IHC檢測到。
總生存期(OS)結(jié)果
排除隨訪時(shí)間不足的患者后,整個(gè)隊(duì)列中位OS為6.95個(gè)月。
p53 IHC染色低于20%的患者中位OS為9.11個(gè)月,高于20%的患者為3.83個(gè)月(P = 0.0071);染色率低于40%的患者中位OS為9.35個(gè)月,高于40%的患者為2.53個(gè)月(P < 0.001);使用多發(fā)性TP53狀態(tài)的7%閾值,染色低于7%的患者中位OS為14.63個(gè)月,高于7%的患者為4.50個(gè)月(P < 0.001)。
研究局限性與下一步計(jì)劃
局限性
樣本量相對較小,可能限制分析能力。
攜帶TP53突變阻止蛋白質(zhì)表達(dá)的患者可能出現(xiàn)假陰性IHC結(jié)果。
使用ICC對TP53突變的定義與世界衛(wèi)生組織的定義略有不同。
下一步計(jì)劃
多機(jī)構(gòu)合作更明確建立p53 IHC和TP53 NGS結(jié)果之間的相關(guān)性,建立跨機(jī)構(gòu)標(biāo)準(zhǔn)。
進(jìn)行額外工作評估p53染色和TP53等位基因狀態(tài)之間的聯(lián)系,開展進(jìn)一步大規(guī)模研究,自信地將p53 IHC染色方法作為TP53突變檢測的首選替代品,但I(xiàn)HC不太可能完全取代TP53 NGS檢測。