淋巴瘤治療對癌癥基因組診斷十分重要
發布日期:2018-02-11實際上,NGS數據中也能獲得拷貝數的改變,和結構重排的信息。但后者結果尚不穩定,還需要做大量的工作,并將大片段插人和缺失的檢測,作為常規分析項目。腫瘤DNA的表觀遺傳學變化也能夠通過NGS確定,但是方法還不適用于臨床應用。淋巴瘤轉診后的這些改變類型,在癌癥基因組診斷上都是重要的,將成為NGS平臺癌癥分子檢測的一部分。
后,基因表達譜檢測是NGS的一個強有力的方法(RNA測序)。通常與可行的基因列表類似,基因表達特征涉及數量有限的基因,并好能夠通過其他方法進行檢測,如用MammaPrint和OncotypeDX預后,生物標記物檢測浸潤性乳腺癌。淋巴瘤轉診治療機構愛諾美康介紹,目前RNA測序是一種強大的科研工具,能夠對差異表達和剪切,對RNA編輯和等位基因特異性表達等進行深入研究,這些發現可能在未來提供更多的分子檢測靶點。
隨著NGS技術繼續發展,淋巴瘤轉診檢測費用將下降,讀長和精確度將提高,分析方法將得到改進。這將使全基因組測序和RNA測序,成為更主流的檢測方法,從而提供綜合癌癥基因組分析數據。這將促進對偶然發現的報道,并提高診斷和預后的能力,從而為個體化治療添磚加瓦。
好早以前,大量研究方法的出現,使得微陣列技術應用到腫瘤的研究中。盡管存在幾種不同的平臺,但所有微陣列技術的基本原理是相同的,它由一個固定于固相載體的大量探針,組成載玻片或芯片。每一個探針都被設計成專一識別單個目標分子的結構,這使同時識別大量目標靶分子成為可能。淋巴瘤轉診后,被標記的靶物質雜交于微陣列芯片,與特異性的探針相結合。因為每一種探針的位置都有特定的標識,所以掃描每一種標識的信號強度,就能得出靶點分子的平行檢測數據。
目標信號的強度與被檢測樣本的量,在一定范圍內是成比例的,這個范圍為高于檢測下限與低于飽和度上限的范圍之間,也就是在系統的動態范圍內。這項應用在淋巴瘤轉診上的技術,有其固有的靈活性,改變排布于微陣列上的探針類型,就能夠檢測不同分子種類。例如,用抗體作為探針的微陣列,能夠用于蛋白質組學分析。
淋巴瘤轉診治療機構愛諾美康介紹,然而,廣泛應用的微陣列類型是DNA微陣列,它是使用DNA探針來定量DNA或RNA(通常是通過cDNA)。DNA微陣列技術應用廣泛,例如以陣列為基礎的比較基因組雜交,以陣列為基礎的基因分型、表觀遺傳學圖譜。但重要的是,鑒于微陣列的廣泛性和靈活性應用,DNA微陣列仍然是轉錄組分析標準的方法。