安德森癌癥中心 很多癌癥由DNA改變引起

海外測序技術(shù)，也被稱為單分子測序系統(tǒng)。該平臺包括兩個流動池，可在其表面捕捉數(shù)十億個DNA分子。由隨機片段和poly-A尾制備的DNA模板，被雜交至反應池表面的poly-T引物所捕獲，從而產(chǎn)生一個單分子測序模板芯片。安德森癌癥中心轉(zhuǎn)診后，加入熒光標記的單種dNTP和DNA聚合酶，從而使得雜交模板鏈，以模板依賴的方式延長。未結(jié)合的dNTP會被洗脫，隨后會進行成像，去除熒光基團，之后是延伸和成像循環(huán)。

幾百個單一堿基延伸循環(huán)過后，可實現(xiàn)平均讀長為25bp。該系統(tǒng)的顯著特征包括與平臺測序相似的以序列，依賴方式進行的非同測序方法。因此，標記的核苷酸沒有末端部分，并且同聚體運行的問題，可以通過限制結(jié)合的速率來解決。此外，安德森癌癥中心轉(zhuǎn)診標記的核苷酸上均聚物連續(xù)結(jié)合，可產(chǎn)生熒光淬滅反應，從而導致一些堿基序列很難被鑒別。

通過檢測在合成過程中，摻入的核苷酸釋放的質(zhì)子，離子激流系統(tǒng)可控制半導體技術(shù)的力量。該技術(shù)區(qū)別于其他測序技術(shù)的一個特點，它是通過測量pH值，而不是通過感光來檢測聚合的。其文庫制備過程類似于測序系統(tǒng)，零散的DNA片段被鏈接到特定的接頭序列，并且一個單一DNA模板被固定到珠子（離子球體粒子）上，并通過使用油包水PCR方法克隆擴增。

被裝載到芯片上，含有dNTP的溶液，以預定的順序流過這些珠子表面，安德森癌癥中心轉(zhuǎn)診后，在每次流動過程中沒有或者有多個dNTP與磁珠結(jié)合。然而測序系統(tǒng)可以順序引入4個核苷酸，而離子激流技術(shù)可以引入32個核苷酸。這個被稱為桑巴的復雜的流動周期，提高了克隆模板在珠子上的同步性，但并未對讀長進行優(yōu)化。單個核苷酸的質(zhì)子釋放，會降低周圍溶液的PH值，從而可以通過離子傳感器，來測得并轉(zhuǎn)換成流量值。Base-caller可糾正這些流量值和信號損失，并將關(guān)鍵碼標準化。

安德森癌癥中心轉(zhuǎn)診機構(gòu)愛諾美康介紹到，癌癥是一種基因疾病，并且所有癌癥的發(fā)生都是由于DNA的改變引起。一個起始核苷酸的改變，不是天生的（胚系突變）就是在細胞復制中出現(xiàn)的（體細胞突變），它是進一步導致核苷酸序列發(fā)生改變的基礎，并終使變化的細胞獲得生長優(yōu)勢。

這些改變允許細胞打破對調(diào)控生長和分化，至關(guān)重要的制約與平衡。臨床對癌癥的處理通常是依據(jù)腫瘤組織來源，和病理學特征進行的。此外，安德森癌癥中心轉(zhuǎn)診后，許多基因組的變化導致蛋白表達的改變，其可用免疫組化方法檢測，從而提供診斷和預后價值，比如，曲妥珠單抗用于HER-2過表達的乳腺癌。