海外醫療 全基因組測序方法的流程

無論是選擇一個有限的基因套餐，還是檢測全部的基因，都要求這些位點能從較大的基因組中分離出來。穩定的方法是使用互補寡核苷酸，捕獲目的基因。目標基因捕獲的特異性，是通過設計寡核苷酸互補序列實現的，這種設計針對目標區域，同時去除重復序列。剪切基因組DNA，并加上連接物，是建立一個全基因組文庫的第一步。海外醫療準備好的DNA在溶液中，與一個長寡核苷酸引物池雜交，捕獲到的片段利用生物素親和素捕獲模式被分離。

通過洗 脫捕獲片段，而去除不需要的DNA。然后洗脫靶DNA，接著擴增，并用于測序。另一可選的方法是多重PCR，即對PCR引物在一個單獨的反應管中進行反應，海外醫療的這個領域是一個活躍的發展領域，新方法和更穩定的方法，正在有規律地進入市場。

海外醫療從技術觀點來看，全基因組測序方法是簡單的，因為它避免了上述的分離目標區域這一步驟。這種更加簡單的工作流程，可能僅需要較少的起始DNA。但如之前提到的，由于測序靶點更大，測序費用確實增加，但它也可為癌癥診斷帶來一個潛在的結果。對于腫瘤科醫師來說，更多的基因組沒有臨床價值，而癌癥基因列表雖切實可用，但稍微有點局限性。

擴大測序的范圍就會犧牲測序的深度，而前者對治療的幫助不大。另外，基因組分析也可能發現，對患者或患者親屬有意義的基因改變，然而這超出了當前快速癌癥診斷的需要。海外醫療服務機構愛諾美康介紹到，美國醫學遺傳學和基因組學學院，近發布指南，推薦明確的偶然發現，應該在不斷增加的基因列表里有報道，這些基因改變可能具有已知或預期的致病作用。

產生DNA測序數據，只是使用NGS進行分子檢測的一部分內容。導出體細胞突變圖譜的數據分析是非常復雜的，有關這些概念和挑戰，近已有綜述進行闡述。復雜的數據分析是NGS推廣至臨床常規應用的一個障礙。NGS平臺銷售商和其他獨立的公司，正在積極提供數據分析的流水線，但數據増長迅速，要全面分析腫瘤基因組，仍缺少必需的工具。海外醫療過程中，校準一個參考基因組的測序讀長，并確定單核苷酸的差別。這種基礎分析也是非常復雜的，其復雜性來源于人類基因組多個區域具有高度的相似性。

一旦確定是體細胞突變，那么接下來的工作，便是研究突變的功能影響。許多檢測到的突變超出了既往有注釋的突變范圍，這些已注釋的突變有明確的功能影響，如某種激酶的激活。突變附近可能沒有受到影響，甚至是失活表型。在一個海外醫療的腫瘤樣本中，觀察到任何高頻突變，都有可能提示它對這種疾病的重要性，但如果沒有功能研究的支持，這只是一個間接的推論。