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海外醫療 基因突變的檢測方法及敏感性

發布日期:2018-02-20

經發現,肥大細胞增多癥的特點,是腫瘤性肥大細胞的克隆性增殖,往往與KIT基因的活化點突變相關。KIT基因,位于染色體4ql2,編碼RTK,與干細胞因子結合后在髓系細胞、肥大細胞、神經嵴細胞(黑色素細胞),和配子的發育中起重要作用。海外醫療后,在AML尤其是CBF-ABL、肥大細胞增多癥、胃腸道間質腫瘤和生殖細胞腫瘤,均發現了K1T基因活化突變。

活化突變會導致KIT基因磷酸化,和下游效應包括STAT、RAS-MAPK和P13K-AKT非配體依賴性激活。肥大細胞增多癥患者,大多數KIT基因突變發生在17外顯子的816密碼子(D816V常見),海外醫療中成人系統性肥大細胞增多癥,突變發生率為50%?95%,兒童皮膚肥大細胞增多癥則為30%?50%。

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海外醫療所報道的突變率范圍較廣,這可能反映了診斷標準,和基因突變檢測方法敏感性的差異,我們的經驗顯示其發生率約75%。其他罕見的KIT突變包括有D820G、E839K、F522C和V560G等。出現D816V突變者對伊馬替尼耐藥,但對其他抑制劑如達沙替尼或突變檢測。樣本進行細胞分選可以進一步提高檢測的靈敏度,但是在臨床應用方面技術上具有挑戰性。

移植后MRD檢測嵌合狀態,即供體和受體細胞的比例可了解 移植后MRD,檢測方法有以下幾種,包括基于PCR的微衛星多態性分析、RQ-PCR和間期FISH(用于供受者性別不同的患者)。研究表明,混合嵌合增加與高風險復發相關。然而,海外醫療過程中受體細胞增加,并不總是預測疾病即將復發的指標,這可能由于檢測方法的敏感性、移植類型、分析的標本來源、患者的年齡及檢測時間的選擇不同所致。

已經證明,海外醫療采用非常敏感的分子方法,可檢測到短暫的混合嵌合,尤其是在非清髓移植后6?9個月,因此,動態檢測比單次檢測結果更有意義。基于PCR的微衛星分析短串聯重復序列(STR),已成為異基因移植后評估嵌合狀態常用的技術。

利用重復序列兩側的引物進行PCR擴增,之后通過基于熒光的毛細管,電泳分析PCR產物的大小,進而計算重復的數量,該技術提供的信息量很大。因為采用多重PCR評估多個STR位點,人們幾乎總能找到每對供受者的至少一個STR位點。海外醫療服務機構愛諾美康介紹到,通過比較電泳 圖譜上峰的面積,STR-PCR可用來定量供者,與受者等位基因的比例,其靈敏度為1%~5%。