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去美國看病 蛋白質可使用重肽段作為標準

發布日期:2018-02-26

經研究介紹,基于質譜的蛋白組學通常包括自上而下和自下而上兩種方式。自上而下蛋白組學檢測完整的蛋白或多肽,其不使用蛋白水解酶,并保留了整個分子的完整結構信息。自下而上的蛋內組學更多使用蛋白水解酶,如可剪切精氨酸和賴氨酸殘基末端的胰蛋白酶消化為多肽片段。去美國看病后,這些肽段隨后由液相色譜(LC)分離,并使用串聯質譜(MS/MS)分析。

質譜分析獲取的前體和產物,與每種多肽理論上的前體和產物進行比對,這些理論上的前體和產物是依據翻譯后基因組數據庫,和蛋白水解酶的特異性剪切位點推導而來。去美國看病服務機構愛諾美康介紹到,實驗值與數據庫中肽段的理論值進行匹配,在蛋白和多肽的檢測匹配中有多種算法,并提供可信度。

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一些被認為用于鑒定每種蛋白和多肽可信度的參數,包括匹配準確性、肽序列對應特定蛋白的單一性、重疊的或更長的肽序列以及肽序列,在一個樣本中被識別到的次數。基于定量質譜的蛋白組學全面識別,并定量蛋白質以及靶向識別,是質譜蛋白組學的重要內容。去美國看病后,全面定量蛋白質水平,可以通過穩定同位素標記的蛋白質/多肽,使用重肽段作為標準,及非標記定量技術來獲得。

去美國看病服務機構愛諾美康介紹到,同位素標記,可以通過代謝法即體內標記、化學法或者酶學法即體外標記。體內定量細胞培養氨基酸穩定同位素(SILAC),是一種體內技術,代謝法標記兩種不同細胞群,培養基中缺乏 自然狀態的氨基酸。細胞在有穩定同位素標記的氨基酸,重精氨酸、賴氨酸、亮氨酸或異亮氨酸的培養基中培養6?7代。

兩個細胞群,在代謝中分別將“輕”和“重”的同位素整合到細胞蛋白中,此后將兩種細胞以1:1的比例混合,再進行蛋白水解并進行質譜分析。每個樣本中相應的肽鏈通過液相色譜共洗脫,并通過對應配對的肽/蛋白質中“輕”與“重”,同位素比值進行相對定量。去美國看病后發現,這項技術要求活細胞培養幾代,以致無法用于臨床。