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去美國看病 如何評價測序的整體質量及用處

發布日期:2018-02-27

國外方面,為驗證測序的性能,在每一次檢測中應設置陽性和陰性擴增對照。陽性擴增對照可以驗證擴增失敗,是否是由于樣品本身的原因。去美國看病在每次檢測中,對每個PCR反應緩沖液,都應設置陰性對照或空白無模板對照,確保沒有發生外源性DNA的污染。

在Sanger測序數據分析之前,應首先評估測序峰圖的質量。質量指標主要包括測序峰圖的振幅和峰圖的背景。峰值的振幅應足夠高,這樣才可以識別出靈敏度范圍內的低水平突變,EGFR缺失突變檢測,應低于每個橫跨感興趣區域核苷酸信號主峰值強度的5%。去美國看病服務機構愛諾美康介紹到,此外,整個檢測中的信噪比應低于2.5%,并且對于評價測序的整體質量也十分有用。

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盡管可以采取一些措施,以保證測序峰圖的質量,但依然存在無法消除的低水平背景,因此,強烈建議采用雙向測序。雙向測序可大大降低因測序過程中,背景噪聲或聚合酶失真而產生假陽性結果的風險。在每一批去美國看病的檢測中,也應設置陰性對照以進一步區分背景信號,和真正的突變信號。由于存在主觀性,需要1名以上的人員分別對測序結果,進行分析并達成共識。

去美國看病服務機構愛諾美康介紹到,假如對樣品的突變狀態無法達成共識,且剩余足夠的樣品,可重復檢測以確定檢測結果。也可以從同一標本中,重新提取核酸以獲得更多的樣品重新檢測。然而,需要注意的是由于腫瘤的異質性,從腫瘤樣本中重新提取的用于確認突變的核酸,也可能產生不同的結果。這種情況在近由CAP組織的一項KRAS測試中得到證實,這項測試(CAP2010 KRAS-B)的結果顯示,2/3的參與實驗室驗證了樣品的KRAS突變,而1/3的實驗室卻沒有檢測到。

這些檢測到的測試結果的差異,可能是由于腫瘤的異質性造成的。去美國看病后,基因芯片是一種以寡核苷酸微陣列為基礎的檢測技術,該技術可在單個反應體系檢測大量的RNA轉錄體,或鑒別基因拷貝數的變異。