出國就醫 臨床標本確認用于完成檢測驗證
發布日期:2018-02-27經研究發現,在檢測腫瘤細胞突變時,合適的陰性對照是從被確定未患腫瘤的個體,取到的正常組織腫瘤的個體。出國就醫服務機構愛諾美康介紹到,這些組織經經驗豐富的病理醫生,確認沒有腫瘤細胞,并且已經用第二種分子學檢測方法證實是陰性。
某些情況下,為謹慎起見可設置多個陰性對照,以確保檢測是正確的。在使用其他腫瘤或癌旁正常組織,做對照時也存在一些陷阱,包括存在用欠敏感方法未檢測到的突變;少量突變陽性的腫瘤細胞浸潤到周圍正常組織中;腫瘤突變的異質性;染色體重排等其他遺傳變異。出國就醫后所有這些因素,將導致確定陰性的Ct值(即陰性閾值)為升高,增加報告假陰性的風險。
已知陰性樣本的檢測,對于證實分析方法的特異性也很重要。qPCR過程中少量非特異性擴增,也會導致報告假陽性結果的風險增加。出國就醫的檢測整體的敏感性,應該采用真實世界的臨床標本(如FFPE或冰凍組織),來進行經驗性的確認,以此來完成檢測方法的驗證。檢測DNA變體或特異轉錄本的探針,是可以商業化購買的。并且可以提供一個敏感性的水平,但其可能只是理論上的,可能并沒有經過常規臨床診斷實驗室中,所檢測的相似材料所確認。
因此,非常有必要用標準接收的樣 本進行敏感性的確認。qPCR檢測時設置幾種對照至關重要,應用內部擴增對照可以確保樣品,有足夠的量用以檢測。突變檢測時,同時檢測該基因的野生型等位基因(WT),和一個在所有組織中都表達的管家基因。出國就醫后,陽性對照設置的目的是為了確保陰性結果,不是由于樣本質量差或是由于定量造成樣本量減少,或是人為誤差等原因。因為qPCK敏感性高,每次檢測都用WT對照,是為了證實沒有交叉污染造成的假陽性。
而不含核酸的空白對照的設置則有助于排除污染,避免假陽性。定量檢測MqPCR是檢測臨床樣品中,特定HNA轉錄本的表達水平,和突變負荷的“金標準”方法。由于定量qPCR的可重復性和敏感性,使其可用來檢測低突變負荷和微小殘留灶。為確保出國就醫后該檢測方法的準確性和可重復性,需要制定相應的檢測及質量標準。
在設計定量qPCR檢測時,需要確定探針的效能。可以通過梯度稀釋拷貝數已知的樣品,并確定每個稀釋液的Ct來實現,這可以利用細胞系或是人工合成的陽性對照。出國就醫應用這些對照來確定探針檢測的上、下限也很重要。