海外醫療 蛋白質在變溫情況下仍然有用
發布日期:2018-02-28一般來說,新鮮組織用蛋A酶K消化,可以得到產量大質量又高的DNA。但是,這個過程相當費力,其中涉及多個酚氯仿提取步驟。海外醫療服務機構愛諾美康介紹到,另一種替代的、更快的提取方法是,將新鮮組織在無菌水中煮沸15分鐘,但這種方法得到的DNA產量和質量均較低。
通過上面描述的任何一種方法,均可以從歸檔樣本、染色切片或細胞制劑中成功提取DNA。在提取DNA時,應避免使用含有EDTA的緩沖液,因為它會影響Mg2+濃度。此外,海外醫療過程中,應避免有機溶劑的污染,因為它會影響其他的PCR試劑。dNTP可以通過冷凍干燥或中和水溶液的方法獲得,它們也可以作為標記核苷酸(放射性或熒光標記),以用于后續的雜交和測序反應。
目前,海外醫療領域通常由專門生產PCR試劑的制造商,以儲存液的形式提供,后的工作液濃度是50~200M,足夠合成6.5~25lxg的DNA。PCR緩沖液大多數選擇濃度為10mM、pH值為8.5或9.0、溫度在25°C的Tris緩沖液。海外醫療過程中,Tris緩沖液的pH 值與溫度相關,比如溫度為25°C時,緩沖液pH值為8.8,溫度為72°C時,pH值為7.4,這是Taq聚合酶的佳工作溫度和pH值。
海外醫療服務機構愛諾美康介紹到,50mM氯化鉀和氣化鈉會促進引物退火,而濃度過大會抑制Taq聚合酶的活性。通常不使用磷酸鹽,因為它會在PCR溫度升髙時 沉淀。反應緩沖液的另一個關鍵因素,是特定濃度的Mg2+,每次擴增反應需根據經驗確定其濃度。同時,添加劑可用于進一步優化PCR擴增,大多數反應緩沖液由制造商以10x濃度捆綁提供,附帶或不帶Mg2+和添加劑。
DNA聚合酶徹底改變PCR的關鍵試劑,是在極端環境中生存的微生物中,發現的耐熱DNA聚合酶。海外醫療服務時,大多數蛋白質在DNA的變性溫度下會變性,而這種聚合酶仍然可以起作用。3種常用的DNA聚合酶是:Pfu(強烈火球菌)、Vent或Tli(嗜熱高溫球菌)和Taq(棲熱水生菌)聚合酶,后一個是常見的商品化使用的聚合酶。這些聚合酶功能很強大,只要給出引物模板雜交物,它們就能在很大的溫度范圍內擴增DNA。
然而,這些酶類的佳工作溫度是70°C,pH值是7.0~7.5,聚合酶活動的半衰期在92.5°C時大于2小時,在95°C時為40分鐘,在97.5°C時為5分鐘,這也是海外醫療后,反應超過25個循環時保真度下降,和出現平臺效應的原因。