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出國治療 引物的延伸需要調整溫度和時間

發布日期:2018-02-28

通常,PCR所需要的循環數和起始目的DNA拷貝數成反比。例如,起始濃度為105的模板分子,需要25個循環才能在凝膠電泳中,經溴化乙錠作用顯出條帶。拷貝數低的目的DMA,需要更多的循環數。出國治療后如果起始時DNA拷貝數為2,鑒于目的DNA在每個PCR循環后將翻倍,那么理論上在n個循環后PCR擴增產物將會擴大很多。

然而經過25個循環,PCR擴增產物將進入平臺期,這是因為反應成分(大部分為dNTP)的消耗導致反應速度減慢。此外,熱變性導致的DNA聚合酶效率穩步下降也是一個原因。出國治療后引物延伸步驟,需要調整溫度和延伸時間。延伸溫度由所使用的DNA聚合酶佳功能溫度決定,而延伸時間由目的DNA序列的長度決定。

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例如,使用Taq DNA聚合酶,經典的延伸溫度是72°C,延伸時間為1分鐘時,可得到長達2kb的產物。PCR試劑因為使用了目標特異性引物,所以,與其他核酸 分析方法相比,PCR的主要優點之一為具有高度特異性。出國治療服務機構愛諾美康介紹到,兩條單鏈引物分別結合到所需要的雙鏈目的DNA序列,引物(通常被定義為上游引物和下游引物)與變性的單鏈DNA互補結合。

設計引物時,要掌握目的DNA序列相關的知識。出國治療設計理想的引物,需注意以下幾個原則:第一,引物應具有特異性,其只能與目的DNA序列結合,以盡量減少非特異性擴增的機會。第二,引物自身或引物之間不應存在互補序列,以防止引物二聚體形成。第三,應該加入比目的DNA摩爾濃度更多的引物,因為引物在每個循環中都會被消耗。

后,優化退火溫度對于特異性來說是很有必要的,因為溫度太低容易產生非特異性結合,而溫度太高會導致退火失敗。退火溫度是由引物的解鏈溫度決定的,出國治療后可讓醫療中心設計引物,并計算每條引物的退火溫度。

出國治療服務機構愛諾美康介紹到,PCR的穩健性,來自于它具有擴增不同來源DNA的能力。如來源于組織、外周血或其他材料。組織可以是新鮮的、冷凍的或是經甲醛固定的。此外,核酸可以是RNA、基因組DNA,或者是線粒體DNA。事實上,PCR是如此強大,甚至能將來源于甲醛固定的石蠟包埋組織中的片段DNA,在納克水平上進行有效地擴增。