去美國看病 基因分型技術(shù)有望用于癌癥研究

十多年前，一項基于單堿基延伸，并利用雙光子激發(fā)熒光來鑒定SNP的技術(shù)被開發(fā)出來，稱為ArcDiaTPX技術(shù)。去美國看病后，該技術(shù)中的引物被固定在微粒上，進行單堿基延伸反應(yīng)。根據(jù)模版DNA的不同，引物延伸反應(yīng)生成一個被標(biāo)記，或者不被標(biāo)記的核苷酸。之后，通過單個微粒的雙光子激發(fā)熒光進行基因分型。

該技術(shù)的可靠性和靈敏度，使用統(tǒng)計學(xué)工具“Z因子”進行評價，“Z因子”是考慮了篩選方法的信號區(qū)間和變異的一種簡單的特征性參數(shù)。去美國看病后，這項技術(shù)用于低至中通量±0.5?150bP測序長度，測序具有高靈敏度、無需分離和高性價比的優(yōu)點。缺點是樣品需要預(yù)擴增，并且每一個樣品的檢測時間較長。

去美國看病服務(wù)機構(gòu)愛諾美康介紹到，快照基因分型技術(shù)和Sequenom分型系統(tǒng)，都被癌癥研究機構(gòu)廣泛使用，并且有希望用于臨床。值得注意的是，這些基因組測試僅能檢測已知變體和癌基因的表達，并不能發(fā)現(xiàn)新的或額外的藥物靶點。

納米級流控技術(shù)的進展，是利用集成流體通路（IFC）進行高通量實時PCR。納升規(guī)模的樣品和試劑，被引導(dǎo)到數(shù)以千計的納升規(guī)模的腔室，并進行不同的實時PCR。近日，Access Array特定基因區(qū)段捕獲系統(tǒng)的發(fā)布，允許檢索PCR產(chǎn)物以用于有針對性的測序。去美國看病過程中，該存取陣列系統(tǒng)可以對并行的24?96個PCR樣本，進行24~96個單重分析，耗時短而且試劑用量小，但精度高。

為證明這一技術(shù)的可行性，去美國看病的研究人員，對已擁有篩選試驗結(jié)果、及細胞系的HapMap數(shù)據(jù)，前列腺癌、肺癌、結(jié)腸癌、卵巢癌（PLCO）的DMA基因分型樣品，進行了分析。這種動態(tài)陣列基因分型系統(tǒng)的準確率高達99.5%，比iPLEX和GoldenGate分析更精確。

一項去美國看病的臨床實驗表明，該系統(tǒng)與TaqMan實時PCR，及Fluidigm平臺的分析結(jié)果，具有99%~100%的一致性?；诖胖樾酒幕蚍中脱芯浚馕吨ㄟ^數(shù)百到數(shù)千個樣本，對每個個體進行幾十萬個SNP的基因分型，并通過邏輯數(shù)據(jù)分析構(gòu)建因果關(guān)系。

目前，市面上高密度的芯片分析平臺，其中一個便是GoldenGate基因分型分析，該技術(shù)使單個反應(yīng)中的延伸，和擴增步驟的位點特異性復(fù)用程度很高。這一分析技術(shù)的有趣特點是，它直接對目的基因組DNA進行分析，去美國看病不需要提前進行PCR擴增。