海外醫(yī)療 共同序列變體可通過測序來發(fā)現(xiàn)
發(fā)布日期:2018-03-05海外醫(yī)療研究方面,通常將PA、Pa、PB、Ph分別作為兩個(gè)位點(diǎn)等位基因的頻率值,那么r2=D2/(pApBpapb),其中一個(gè)度量LD幅度的指標(biāo)為D=PAB-PAPB。D是LD的測量指標(biāo),表示一對等位基因分離后,隨機(jī)分布于兩個(gè)單倍體基因座的頻率。當(dāng)0.8<r2<l時(shí),LD更強(qiáng)。國際人類基因組計(jì)劃,進(jìn)行了世界范圍內(nèi)人群的基因分型項(xiàng)目,以計(jì)劃開展全人類單體型圖譜。
同時(shí)了解人類遺傳分布的圖譜,并為將來GW AS結(jié)果的精煉和分析提供數(shù)據(jù)。海外醫(yī)療近的人基組計(jì)劃,其目的是采用“新一代”測序技術(shù),在大型和不同種族的人群集合,定義常見和低頻變異,其將為SNP的篩選提供更好的基因圖譜。
GWAS的同有設(shè)計(jì)是這樣的,顯著相關(guān)的SNP是少見的,其僅偶爾與表型發(fā)生因果聯(lián)系,并代替LD成為一個(gè)功能上重要的變體。發(fā)現(xiàn)這些偶然變體,對于了解疾病發(fā)病的分子機(jī)制是重要的。接下來,需要更多深入研究補(bǔ)充GWAS,如細(xì)化和插補(bǔ)研究,來識別致病等位基因。海外醫(yī)療這些涉及在GW AS已發(fā)現(xiàn)的SNP附近的已知常見序列,而這些SNP與感興趣的疾病相關(guān)。
海外醫(yī)療服務(wù)機(jī)構(gòu)愛諾美康介紹到,適當(dāng)共同序列變體,可以通過訪問千人基因組的SNP數(shù)據(jù)庫,或者通過對感興趣區(qū)域的重新測序來發(fā)現(xiàn)。細(xì)化GWAS信號,并識別偶發(fā)SNP的另一種方法是進(jìn)行插補(bǔ)。