出國就醫(yī) 微陣列技術(shù)還可觀察蛋白之間的關(guān)系

經(jīng)臨床研究發(fā)現(xiàn)，獲得高平均值的部分被定義為峰值，峰值的不同顯示RNA分子是正處于活躍轉(zhuǎn)錄，還是非活躍轉(zhuǎn)錄狀態(tài)。出國就醫(yī)服務(wù)機(jī)構(gòu)愛諾美康介紹到，DNA序列和結(jié)構(gòu)的分析，包括是否存在特定堿基對(duì)序列變異，也稱為重新排序或基因型，以及基因組不同區(qū)域的拷貝數(shù)狀態(tài)。

單核苷酸多態(tài)性（SNP），是DNA序列中單個(gè)核苷酸水平的變異，其發(fā)生于部分人群中。隨著技術(shù)的進(jìn)步，單核苷酸的變化能夠通過高通量陣列如微陣列識(shí)別。出國就醫(yī)后，幾種以分餾為基礎(chǔ)的SNP富集方法已被應(yīng)用。簡(jiǎn)而言之，就是將DNA在限制性內(nèi)切酶的混合物中孵育，這樣就可以在DNA片段的末端，得到短的凸起。

引物識(shí)別這些短凸起，隨后與DNA片段結(jié)合，并以銜接子介導(dǎo)的PCR進(jìn)行擴(kuò)增有時(shí)，在PCR擴(kuò)增之前，對(duì)DNA片段的大小進(jìn)行篩檢，以降低樣本的復(fù)雜性。擴(kuò)增的DNA在片段化后，標(biāo)記上熒光，并雜交于SNP陣列。出國就醫(yī)后不同的需求陣列，需要進(jìn)行預(yù)處理，然后才能分型為AA、AB或BB基因型，SNP陣列有各種不同的預(yù)處理方法。

在標(biāo)準(zhǔn)化之前，一些方法可以校正探針序列和片段長度。陣列的強(qiáng)度被分位數(shù)標(biāo)準(zhǔn)化，從而保證了所有的樣本，有相同的分布。出國就醫(yī)通常使用中位數(shù)平滑分析，概括與同一SNP中相同等位基因結(jié)合的探針。有多種基因型算法可以被用，用得比較成功的算法，包括對(duì)已知基因型的初 分析。

除了基因型分析，拷貝數(shù)量也能通過SNP陣列獲得，方法為使用分層聚類方法或P值閾值選擇和非隱馬爾科夫模型。對(duì)于基因拷貝數(shù)量的變異分析，使用頻率更多的方法，通常是比較基因組雜交，其能同時(shí)測(cè)定400萬個(gè)單核苷酸。

出國就醫(yī)服務(wù)機(jī)構(gòu)愛諾美康介紹到，來自一個(gè)樣本（例如腫瘤）和另一個(gè)樣本（例如正常組織）的基因組，DNA用不同的熒光標(biāo)記（分別用Cy5和Cy3）。來自這兩個(gè)樣本的DNA，都雜交于cDNA微陣列。熒光強(qiáng)度比值顯示基因拷貝數(shù)的狀態(tài)，色（Cy5）代表腫瘤樣本中基因拷貝數(shù)的獲取，綠色（Cy3）代表腫瘤組織中基因拷貝數(shù)的丟失，黃色代表與正常組織相比DNA拷貝數(shù)沒有變化。

多重分割元方法，使數(shù)據(jù)資料分割成相等拷貝數(shù)的單元，一些方法包括HMM法（HMM）、循環(huán)二進(jìn)制分割法（CBS）和高斯模型法（GLAD等。出國就醫(yī)后發(fā)現(xiàn)，表觀遺傳學(xué)方面的應(yīng)用，除了直接測(cè)定RNA和DNA分子，微陣列技術(shù)還應(yīng)用于觀察蛋白和DNA之間的關(guān)系。