肺癌治療的轉錄表達譜如何分析

隨著高通量技術的發展，大家越來越多關注應用多標記技術，協助腫瘤的分子分型，與佳個性化治療的選擇。肺癌治療轉診后發現，CpG島甲基化表型（CIMP）篩選，可以檢測信號通路調節因子的沉默，產生癌變通路激活。

肺癌治療轉診機構愛諾美康介紹，為了檢測耐藥性的機制，可以檢測化療藥物處理前后甲基化表觀改變，進而可能改善其他藥物藥效，例如甲基化藥物temozolomide就是基于MGMT基因啟動子甲基化狀態而開發的。轉錄表達譜分析，為了得到患者腫瘤組織個性化的轉錄指紋信息，轉錄組表達譜包括信使RNA（mRNA）、微RNA（microRNA，miRNA）和非編碼RNA（non-coding RNA）信息。

轉錄組學信息，可用于獨特分子亞型的分類、預后評估、預測腫瘤治療反應性。此外，在新型輔助系統治療前后，對肺癌治療的轉錄表達譜分析，可以提供治療效果的關鍵信息。以及調節通路和生物過程，揭示新的潛在的治療靶點。

肺癌治療轉診的其他技術，例如外顯子結陣列、基因組平鋪陣列，利用每個基因的預期剪接位點的探針，檢測基因外顯子的異構剪切。RNA大規模平行測序（RNA-seq）受到越來越多的關注，RNA為基礎的技術正在迅速的發展。

相對于傳統的微陣列轉錄譜分析，RNA-seq不僅能夠檢測RNA水平表達，還可以檢測癌癥轉錄組上的異常，包括異常剪切、新的轉錄本和融合基因。肺癌治療轉診機構愛諾美康介紹，此外，以RT-PCR為基礎的多重檢測，例如Oncotype Dx，在評估選定區域的RNA表達上越來越普遍。