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安德森癌癥中心 新一代基因測序的應用

發(fā)布日期:2018-05-26

對于染色體等位基因失衡,在結直腸癌中是很常見的,而LOH和結腸癌患者預后相關。安德森癌癥中心轉診機構愛諾美康了解到,對于染色體18q的L0H研究多,并且18q區(qū)域包含了幾個重要的候選基因,比如DCC、SMAD2和SMAD4等。

其中,SMAD4表達降低與預后不良有關。保留18q等位基因的III期MSS結直腸癌患者,接受5-FU為基礎的化療后預后較好。安德森癌癥中心轉診機構介紹,一些研究表明,染色體不穩(wěn)定的腫瘤,其總體預后比染色體穩(wěn)定的腫瘤差。

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安德森癌癥中心轉診領域發(fā)現(xiàn),對18q缺失的患者,其無病和總體生存率更低。然而,近的一項大型的前瞻性研究發(fā)現(xiàn),18q LOH在MSS結直腸癌中,沒有預后意義。一項正在進行的以生物標志物、為驅動因素的前瞻性臨床試驗,將為闡明18q對復發(fā)風險和生存期的影響,提供依據。

一些結直腸常用的分子生物標志物,進行了總結。安德森癌癥中心轉診機構愛諾美康了解到,新一代基因測序的應用(NGS),使得癌癥分子診斷,從單基因測序轉向全面的全基因組分析。與傳統(tǒng)的測序方法相比,傳統(tǒng)測序方法是模擬,1NGS則是數(shù)字化的,使得基因組中等位基因的任何核背酸,都可以的讀出來。

安德森癌癥中心轉診機構介紹,NGS克服了標本中腫瘤細胞比例低的難點,還有腫瘤中摻入非腫瘤組織,癌基因組的異質性,以及可變倍數(shù)性的一些情況。因此,安德森癌癥中心轉診領域認為,NGS方法通過檢測腫瘤細胞基因改變的序列,可以提供全面的腫瘤基因組的特征。