出國(guó)就醫(yī) 染色體位點(diǎn)可能導(dǎo)致頻繁激活

國(guó)外的一項(xiàng)ICGC的試驗(yàn)中，目標(biāo)是獲得并分析50種不同類(lèi)型的癌癥，和亞型的基因組異常改變，因此ICGC的主要力量集中，在癌癥基因組的配對(duì)末端序列分析。出國(guó)就醫(yī)服務(wù)機(jī)構(gòu)愛(ài)諾美康了解到，而針對(duì)整合基因組的分析上，該方法會(huì)讓綜合分析癌癥相關(guān)的體細(xì)胞事件成為可能。

然而需要區(qū)分出不相關(guān)的“伴隨”改變，和驅(qū)動(dòng)腫瘤發(fā)生的畸變，例如多種癌癥普遍具有大量的核型異常等。出國(guó)就醫(yī)領(lǐng)域發(fā)現(xiàn)，甚至小樣本的微陣列CGH或LOH譜，也暗示眾多染色體區(qū)域包含大量在癌癥中，并不起重要作用的基因。

出國(guó)就醫(yī)服務(wù)機(jī)構(gòu)愛(ài)諾美康介紹，已經(jīng)證明發(fā)現(xiàn)高頻改變，對(duì)于優(yōu)選染色體位點(diǎn)非常有用，然而這些方法可能需要大樣本量，并且對(duì)于鑒定由突變、甲基化、轉(zhuǎn)錄抑制或其他方式，可能導(dǎo)致頻繁激活或失活。出國(guó)就醫(yī)服務(wù)機(jī)構(gòu)了解到，而非大規(guī)模基因組畸變的情況，通常則無(wú)明顯效果。

再者一條通路中的多個(gè)基因的基因組畸變，在功能上可能是相等的，特定通路中的基因可能在基因組畸變中共同起作用，且頻率會(huì)遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于單個(gè)基因成員。出國(guó)就醫(yī)領(lǐng)域認(rèn)為，整合多種類(lèi)型的基因組數(shù)據(jù)，對(duì)于闡明體細(xì)胞癌癥遺傳學(xué)的復(fù)雜性，顯然是必需的。

有三項(xiàng)研究整合了高分辨率DNA拷貝數(shù)、基因表達(dá)數(shù)據(jù)和大規(guī)模測(cè)序數(shù)據(jù)，為膠質(zhì)母細(xì)胞瘤和胰腺癌的突變復(fù)雜性，和主要通路提供了清晰的圖譜。出國(guó)就醫(yī)服務(wù)機(jī)構(gòu)愛(ài)諾美康介紹，這些研究確實(shí)鑒定出大量在癌癥中突變的新基因，還發(fā)現(xiàn)了相對(duì)稀少的未知高頻突變基因。