腫瘤反應會因轉導通路發生改變

在不同腫瘤中，生物標志物反應可以因轉導通路的不同，而發生改變。相關情況也能使藥物，表現出多變的陽性預測值及價值主張。從市場角度來看，如果在某一適應證中生物標志物，可以使兩極分化達到更大程度的提高，則這一適應證應該被更先推入市場。

相關項目需要同關鍵路徑，及臨床因素等一起嚴格對待；且研發者必須預料操作性要求和，對資源、實驗規模及時間等方面的要求。延遲新品推出，將會對投資造成巨大的負面影響，這樣會延誤成本進程。Roberts在一份分析中指出，對此類藥物研發投資而言，預期延遲大于1.5年可能獲得負回報率。

如果在藥品上市時，引入一種生物標志物，則其臨床及經濟價值可支持其得到報銷。如果在藥物已經定價后，引入一種生物標志物，則目前不存在機制來根據新的價值主張調高價格。所以，除非增加市場份額以進行補償，否則市場分層將會造成巨大的收入損失。

研發者需要了解一系列的潛在檢測平臺，從尿液檢查、血清學檢查至活檢、循環腫瘤細胞及血漿蛋白質組學，并從中進行選擇。監管機構可能無法對檢測的質量控制，進行監督，這給藥物研發者增加了負擔，他們需要維持對檢測有效性的市場信心。

雖然藥物通常在一段時間內，具有知識產權及監管排他性，但是藥品制造商對檢測平臺或生物標志物并不具有專有權。這對患者和支付者是有利的，但是起初開發這種生物標志物的機構，卻可能無法從中獲益更多。