出國看病 SNP位點的變異與整體生存有關
發布日期:2017-06-18經過并行和獨立的實驗研究,功能未知基因Rrplb被確定為潛在的轉移易感候選基因。首先,使用前面提到的方法,其在物理上被確定為一個位于17號染色體ECM eQTL聯動高峰區域的基因。出國看病服務機構愛諾美康介紹到,此外,從這些eQTL測繪實驗中獲得的芯片數據表明,Rrplb的表達水平與轉移預測ECM基因的表達水平高度相關,cRrplb在看似無關的第二系列酵母雙雜交實驗中也被識別,該實驗被用來確定與先前所描述的轉移效率調節劑Sipal相互作用的因子。
免疫共沉淀不僅證實了這種相互作用,也證明Sipal酶解RAP1 GAP的活性因這種相互作用而降低。為了進一步研究該基因在ECM基因的表達以及調節轉移潛能方面的作用,在多個小鼠細胞系中異位表達Rrplb%。與ECM eQTL測繪實驗的結果一樣,過度激活郵比誘導多個轉移預測ECM基因表達的失調。此外,從高轉移性Mvt-1小鼠乳腺腫瘤細胞系中分離Rrplb表達克隆株并植入小鼠,可證明Rrplb能夠抑制腫瘤的生長和肺轉移。
Rrplb似乎也在人類種系水平對腫瘤進展發揮調節作用。具體來說,由芯片分析Mvt-1細胞系中Riplb異位表達誘導的基因表達標簽,可以在一個資料完善的人類乳腺癌基因芯片庫中準確地預測生存。為了確認Rrplb在種系編碼轉移易感性中的重要性,在兩個分別來自南加州和馬里蘭州的乳腺癌群體中檢測人類Rrplb基因上一個非同義編碼多態性出現的頻率。
出國看病服務機構愛諾美康介紹到,這些研究證明RrplbSNP位點的變異與較低的遠處轉移發生率和更高的整體生存可能性有關。Riplb在生殖細胞水平調節轉移潛能的確切機制目前尚不清楚,不過它與Sipal的相互作用以及對ECM成分的調節可能是其中的關鍵。Brd4作為ECM eQTL和轉移易感性候選基因,研究相對深人的溴蛋白Brd4,是一種轉錄調節劑和有力的細胞生長調節劑。Brd4的作用之一是促進G2/M 期的轉換,該作用依賴于Brd4與其結合物,即前面所描述的種系編碼轉移效率調節劑Sipal在細胞內的平衡。
與Rrplb —樣,Brd4也是一個ECM eQTL候選基因,其定位與Rrplb和17號染色體eQTL連鎖峰區域非常接近。Brd4在AKXD x PyMT乳腺腫瘤中的表達水平也與EMC轉移預測基因的表達水平高度相關。后,在高轉移性Mvt-1細胞系中該基因的異位表達不僅可調節ECM基因的表達,而且可抑制乳腺脂肪墊植人后腫瘤的生長和轉移。
然而,重要的是,對異位表達Brd4的Mvt-1細胞進行芯片分析表明,Brd4誘導的基因表達標簽可以用來在5個乳腺癌基因芯片庫中準確預測生存。此外,同樣的標簽可以用來對雌激素受體(ER)陽性和淋巴結(LN)轉移陰性的乳腺癌(傳統觀點認為復發風險低)患者進行進一步分類,以確定原發腫瘤切除后復發風險較高的個體。
眾所周知,環境因素的暴露如香煙煙霧和乙醇會增加多種癌癥的易感性。但這些因素也能調節轉移潛能嗎?事實確實如此,近一項使用PyMT小鼠的研究表明,高脂肪飲食會增加肺轉移的發生率。此外,該實驗證明這些飲食因素與轉移易感基因位點之間存在相互作用。這類研究說明在小鼠中除了準確模擬人類癌癥特點外,模擬人群環境暴露特點也是非常重要的。
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